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Este programa fue creado mediante Acuerdo No.107 de diciembre 12 de 1994 del Consejo Superior. Con acreditación de Alta calidad renovada por seis años mediante Resolución No.1244 de 21 de febrero de 2011 del Ministerio de Educación Naciona. Su misión es formar profesionales en biología de manera integral con una fundamentacion teórica, científica y tecnológica que permita su participación responsable en los avances de la Ciencia y la Tecnología para que, como miembros activos de la comunidad académica, influyan con responsabilidad en el desarrollo sostenible local, regional y nacional.

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ABORDARJE DE ESTRATEGIAS METODOLÓGICAS PARA EL ANÁLISIS DE LA ESTRUCTURA GENÉTICA EN POBLACIONES DIVERSAS: IMPORTANCIA EN EL RIESGO DE ENFERMEDADES NO TRANSMISIBLES
(Universidad del Tolima, 2024) DIAZ CARMONA, DANNA CAMILA; CRIOLLO RAYO, ANGEL ALEXANDRO; BOHÓRQUEZ LOZANO, MABEL ELENA
Introducción: Los eventos demográficos tales como la deriva génica, la migración, la mutación y la selección natural, han dejado huella en la estructura genética de las poblaciones, permitiendo el surgimiento de variaciones específicas en cada una de ellas. En la última década, los avances en los métodos de análisis genómico, que han permitido la creación de bases de datos, han proporcionado un marco sin precedentes, para la comprensión de la estructura genética de las poblaciones humanas y su asociación con enfermedades no transmisibles (ENTs). No obstante, existen pocos estudios en poblaciones geográficamente diversas y quedan por subsanar restricciones existentes a nivel tecnológico, que han limitado la comprensión de pequeñas variaciones, especialmente importantes en estas poblaciones. Objetivo: Abordar estrategias metodológicas relacionadas con el análisis de procesos evolutivos que han moldeado la estructura genética de las poblaciones diversas, a través de la revisión de las publicaciones más recientes con el fin de analizar el impacto de dichos procesos en las ENTs. Metodología: La investigación bibliográfica de esta monografía se desarrolló entre mayo y julio del 2023, a través de la consulta de artículos científicos y metaanálisis en inglés publicados desde el 2015, utilizando la herramienta de búsqueda automatizada en las bases de datos de los sistemas de referencia Scopus, PMC, Google Scholar y Springer Link. Conclusión: Se postula la inferencia de la ascendencia genética en poblaciones mixtas como una herramienta esencial para controlar el efecto de la estratificación de la población en estudios genómicos, ya que permite la identificación de genes asociados a enfermedades no transmisibles.
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Abundancia y diversidad de hongos formadores de micorrizas arbusculares asociadas a la vegetación circundante en un área de minería del municipio de Santa Isabel, Tolima
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2017, 2017) Guzmán Lasso, Herik Johan; Perdomo Useche, Yessica Lorena
La minería genera un impacto sobre los suelos, hábitat que soporta la cadena trófica. A pesar de ser evidentes los cambios en el suelo y la cobertura vegetal por la acción minera, poco se conoce sobre los organismos en estos ambientes. Los Hongos Formadores de Micorrizas Arbusculares (HFMA), son fundamentales por establecer relaciones simbióticas con la mayoría de las plantas, característica esencial para la recuperación de los suelos. El objetivo de este estudio fue caracterizar la abundancia y diversidad de la vegetación y HFMA en una zona afectada por la minería de oro en Santa Isabel-Tolima. La vegetación fue evaluada en dos áreas; una adyacente a los depósitos mineros y con vegetación nativa (SI-N) y otra intermedia con desechos mineros e inicio de sucesión vegetal natural (SI-SV) y los HFMA en el área SI-N y el área de desechos de minería (SI-M). La vegetación se cuantificó por la metodología RAP y los HFMA por el método de tamizado en húmedo a partir de suelo directo y cultivos trampa. Identificando 605 individuos, pertenecientes a 29 familias, 46 géneros y 54 especies vegetales y de HFMA 13 especies y 11 géneros, siendo 23 veces mayor en el área SIN, con Glomus microcarpum, como el más frecuente en ambas áreas. La diversidad, se determinó mediante los números de Hills, donde el área SI-N fue mayor en la vegetación (Q1: 11,94) y el área SI-M en los HFMA (Q1: 4,17). Se destacan las especies vegetales Baccharis latifolia, Agrostis sp, y Miconia sp y los HFMA del genero Glomus por ser potenciales en la fitorremediación. Palabras claves: Micorrizas, Suelo, Relaves, Fitorremediación
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Acilación e hidrólisis de almidón de arroz catalizada por Aspergillus niger Y Rhizopus oryzae bajo un sistema de inmovilización
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2018, 2018) Aldana Porras, Álvaro Esteban
En el departamento del Tolima durante el proceso de molinería del arroz se generan subproductos de menor valor económico como el arroz partido, del cual es posible extraer almidón con altos rendimientos, siendo un material del cual se busca ampliar sus usos industriales a través de procesos de modificación, siendo una opción los métodos enmarcados dentro de la química verde. En el presente trabajo se evaluó la capacidad biocatalítica de los hongos Aspergillus niger y Rhizopus oryzae bajo un sistema de inmovilización en reacciones de acilación e hidrólisis de almidón de arroz de la variedad 473. Para la inmovilización de los hongos se evaluaron 3 medios de cultivo y 2 soportes. Anhídrido acético y ácido maleico se usaron como agentes acilantes. La acilación se verifico por FT-IR, igualmente se analizaron cambios en la solubilidad, poder de hinchamiento e índice de absorción de agua de los productos modificados. Esto para la verificar la inserción de los ácidos orgánicos en la molécula de almidón que aumentan la conformación amorfa del polímero evidenciando la modificación de estas propiedades. El polímero modificado con anhídrido acético evidencio cambios en PH y IAA, mientras que el tratado con ácido maleico mostro cambios en el ISA. En la hidrólisis del polímero se obtuvieron porcentajes del 40% que contrastados con literatura muestran un alto rendimiento en relación con la baja carga enzimática que pueden tener los hongos inmovilizados. Por lo anterior la inmovilización de hongos presenta potencial como alternativa biotecnológica para el reemplazo de procesos convencionales de transformación de materias primas como el almidón de arroz. Palabras clave: Aspergillus, Rhizopus, Modificación, Almidón, Biocatálisis.
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Acilación e hidrólisis de almidón de arroz catalizada por Aspergillus niger Y Rhizopus oryzae bajo un sistema de inmovilización.
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2018, 2018) Aldana Porras, Álvaro Esteban
En el departamento del Tolima durante el proceso de molinería del arroz se generan subproductos de menor valor económico como el arroz partido, del cual es posible extraer almidón con altos rendimientos, siendo un material del cual se busca ampliar sus usos industriales a través de procesos de modificación, siendo una opción los métodos enmarcados dentro de la química verde. En el presente trabajo se evaluó la capacidad biocatalítica de los hongos Aspergillus niger y Rhizopus oryzae bajo un sistema de inmovilización en reacciones de acilación e hidrólisis de almidón de arroz de la variedad 473. Para la inmovilización de los hongos se evaluaron 3 medios de cultivo y 2 soportes. Anhídrido acético y ácido maleico se usaron como agentes acilantes. La acilación se verifico por FT-IR, igualmente se analizaron cambios en la solubilidad, poder de hinchamiento e índice de absorción de agua de los productos modificados. Esto para la verificar la inserción de los ácidos orgánicos en la molécula de almidón que aumentan la conformación amorfa del polímero evidenciando la modificación de estas propiedades. El polímero modificado con anhídrido acético evidencio cambios en PH y IAA, mientras que el tratado con ácido maleico mostro cambios en el ISA. En la hidrólisis del polímero se obtuvieron porcentajes del 40% que contrastados con literatura muestran un alto rendimiento en relación con la baja carga enzimática que pueden tener los hongos inmovilizados. Por lo anterior la inmovilización de hongos presenta potencial como alternativa biotecnológica para el reemplazo de procesos convencionales de transformación de materias primas como el almidón de arroz. Palabras clave: Aspergillus, Rhizopus, Modificación, Almidón, Biocatálisis.
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Actividad antioxidante y antimicrobiana del extracto vegetal obtenido de un cultivo comercial de Stevia rebaudiana ubicado en Olaya Antioquia
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2017, 2017) Morales Orjuela, Laura Tatiana
En este trabajo se evaluó la actividad antioxidante y antimicrobiana de los extractos de hoja, tallo y hoja agotada de un cultivo comercial de Stevia rebaudiana, ubicado en el municipio de Olaya (Antioquia), a través de los métodos ABTS, DPPH, Folin-Ciocalteu y discos Kirby-Bauer frente a Staphylococcus aureus (Gram positiva) y Escherichia coli (Gram negativa); también la modificación de pozos en agar PDA con Fusarium oxysporum. Los resultados para los métodos ABTS, DPPH y fenoles totales indicaron mayor actividad antioxidante (p<0.05) para el extracto obtenido a partir de la hoja, con valores de 648 μM Trolox equiv/g peso-1, 541 μM Trolox equiv/g peso-1, y 10,2 mg ácido gálico equiv/g masa seca-1, respectivamente. Adicionalmente, se evaluó la actividad antimicrobiana de los extractos sobre S. aureus y E. coli, evidenciando un halo de inhibición, como rastro de actividad bacteriostática, en los tres extractos evaluados (hoja, tallo y hoja agotada). Asimismo, se cuantificó el porcentaje de inhibición del crecimiento del hongo F. oxysporum frente a los extractos, obteniendo como resultado un 50% de actividad fungicida para el extracto de hoja, 28% en tallo y 12% en hoja agotada, siendo el extracto a partir de hoja el que presentó mayor actividad fungicida (p<0.05). Por último, este trabajo permite conocer el potencial antioxidante y antimicrobiano que posee el extracto de Stevia rebaudiana, con el fin de aprovechar los residuos (tallo y hoja agotada) que se generan luego del proceso de selección de material vegetal y extracción, generando nuevas herramientas e información acerca de las propiedades y beneficios que se pueden obtener de esta planta. Palabras Claves: Stevia rebaudiana, Extracción, Actividad antioxidante, Actividad antimicrobiana.
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Actividad biológica del veneno de dos especies de serpientes opistoglifas del departamento del Tolima
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2016, 2016) Torres Bonilla, kristian Alberto
Las serpientes opistoglifas poseen colmillos posteriores acanalados conectados a la glándula de Duvernoy, la cual produce secreciones tóxicas que ayudan a la captura y pre-digestión de la presa. El veneno de estas serpientes es poco estudiado debido a las dificultades que se presentan en el proceso de extracción del veneno y por ende a obtener suficientes cantidades de veneno para su estudio; sin embargo, han sido reportados casos graves de envenenamientos ocasionados por estas serpientes, lo cual las hace una fuente de estudio importante. Este trabajo evaluó algunos efectos y actividades biológicas in vitro de los venenos de las especies opistoglifas L. annulata y E. bizona in vitro. Se estableció un método de extracción directo utilizando microcapilares, el cual es un procedimiento no invasivo y con el que se obtienen resultados buenos en cuanto a su rendimiento. La toxicidad (DL50) de los venenos de las dos especies evaluadas en ratones (6,5 μg/ml para Leptodeira annulata y 3,5 μg/ml para Erythrolamprus bizona) fue moderadamente alta comparada con otras especies, indicando una importante toxicidad en mamíferos. El veneno de Leptodeira annulata causó un bloqueo moderado de la contracción muscular en aves y uno leve en mamíferos; sin embargo, este veneno redujo la respuesta de acetilcolina y cloruro de potasio exógeno en músculos de ave indicando un daño importante de las fibras musculares, además de inducir una despolarización de la membrana de las células musculares en preparaciones de mamífero. El veneno de Erythrolamprus bizona tuvo efectos muy similares al anterior, pero en una concentración determinada de 30 μg/ml se presentó una súper-estimulación en la respuesta de la acetilcolina indicando una posible acción inhibidora de la acetilcolinesterasa. Los dos venenos estudiados presentaron resultados muy similares en las actividades enzimáticas que se evaluaron: actividad proteolítica muy alta, actividad fosfolipasa A2 baja y actividad por serín proteasas inexistente. Los análisis morfológicos a través de técnicas histológicas revelaron las alteraciones musculares ocasionadas por los venenos, las cuales constan de lesiones delta, necrosis, edema y vacuolización de las fibras. En conclusión, los resultados muestran que el veneno de Leptodeira annulata y Erythrolamprus bizona causan grandes efectos miotóxicos en preparaciones neuromusculares de vertebrados, probablemente debido a la alta actividad proteolítica que envuelve la acción de metaloproteasas. Palabras Clave: Glándula de Duvernoy, Miotoxicidad, Neuromuscular, Opistoglifas.
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Actividad polifenoloxidasa durante la interacción de semillas de Rodriguezia granadensis expuesta a endófitos aislados del estado silvestre.
(Universidad del Tolima, 2020) Pulido Rivera, Karol Dayana
Las orquídeas requieren de la interacción simbiótica con hongos micorrízicos para la germinación de las semillas en condiciones naturales. A pesar de la importancia de esta relación, se conoce poco aún sobre la especificidad y fisiología de la interacción, siendo esta última indispensable para conocer la ecología de las especies. La compatibilidad hongo-planta ha sido evaluada en diversas micorrizas a través de la determinación de la actividad Polifenoloxidasa, constituyéndose como un biomarcador de interacciónes y colonización fúngica. De acuerdo a lo anterior, en el presente estudio se evaluó la relación de la actividad polifenoloxidasa durante el proceso de interacción de semillas de Rodriguezia granadensis con hongos endófitos aislados de condiciones naturales. Los hongos se identificaron mediante la secuenciación de rRNA-ITS y se caracterizaron por tasa de crecimiento y actividad PPO. Se identificaron los endófitos Colletotrichum, Nigrospora, Alternaria y dos Ceratobasidium. La actividad de PPO se relacionó con los cambios morfológicos de las semillas, los hongos productores de daño exhibieron una actividad de PPO promedio más alta, mientras que las micorrizas potenciales (Ceratobasidium) una actividad comparativamente menor. En este sentido, las diferencias significativas en la actividad de PPO se asociaron con la resistencia de la semilla y la tendencia del metabolismo trófico en endófitos, lo que evidencia el potencial de PPO como un biomarcador de compatibilidad en interaccion hongo - orquídeas.
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Adaptación acústica en el canto de las especies de aves neotropicales cyclarhis gujanensis e hylophilus flavipes y sus densidades poblacionales en la zona de vida bosque seco tropical en el departamento del Tolima.
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2014., 2014) Pacheco Vargas, Gustavo Fabián; Losada Prado, Sergio (Director)
En la actualidad el bosque seco tropical constituye uno de los ecosistemas más amenazados en el Neotrópico; el departamento del Tolima hace parte la región seca del valle del rio Magdalena, en esta región existen importantes asentamientos humanos y las carreteras que se encuentran en la zona favorecen la movilidad hacia cualquier parte del país. Se fijaron como objetivos determinar la adaptación acústica en el canto de las especies Cyclarhis gujanensis e Hylophilus flavipes en respuesta al ruido producido por el tráfico y estimar la densidad poblacional de estas especies. Se efectuaron transectos lineales paralelos a las carreteras de las tres localidades; en estos transectos se realizó el registro de individuos, la grabación de sus cantos y la medición de la intensidad de ruido emitido por los vehículos. A partir de este estudio se encontró que Hylophilus flavipes emite cantos con una frecuencia mayor cuando se encuentran en lugares cercanos a una carretera; Cyclarhis gujanensis tiende a presentar esta respuesta. Así mismo, Hylophilus flavipes genera cantos más duraderos, con mayor cantidad de notas y con una duración entre notas más corta cuando los individuos se ubican en lugares donde la intensidad del ruido está por debajo de los 40 dB. La densidad poblacional de Cyclarhis gujanensis se relaciona de forma directa con el área de bosque al cual se encuentre asociado. La densidad poblacional de Hylophilus flavipes está relacionada de forma directa con el número de parches de vegetación en regeneración, el área y numero de cercas vivas.
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Análisis acústico, genético y morfométrico en ranas venenosas andinas de Colombia
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2014, 2014-05) Medina Rengifo, Ricardo Andrés
Tanto la bioacústica, como la genética y morfometría son herramientas ampliamente utilizadas en estudios taxonómicos, ecológicos, evolutivos, sistemáticos o de conservación en Anuros. La hipótesis de aislamiento por distancia indica que las especies comparten una mayor relación filogenética a medida que la distancia entre estas disminuye. Para entender como la distribución geográfica actúa sobre las características acústicas, morfométricas y las relaciones filogenéticas del género Andinobates (Anura), se utilizó un enfoque integrativo en donde se grabaron llamadas de anuncio de diferentes especies de Andinobates localizados en cinco puntos de Colombia, además se midieron 8 variables morfológicas y se tomaron muestras genéticas a través de frotis (swabs) bucales. Los resultados mostraron que las especies se encuentran bien definidas taxonómicamente tanto por parámetros acústicos como morfométricos. Sólo a nivel acústico y genético la hipótesis de aislamiento por distancia puede correlacionarse con las especies. Tanto la topología del árbol filogenético reconstruido junto con la prueba de distancias genéticas (K2P) confirman indudablemente que la población de Andinobates presente en el municipio de Líbano (Tolima) es afín a A. dorisswansonae, lo que indica que existe un morfotipo diferente con divergencia acústica e incremento del tamaño corporal, siendo este en modelo interesante para futuras investigaciones en selección sexual y natural.
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Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania
(Ibague : Universidad del Tolima, 2013., 2013-08) Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana
El alineamiento múltiple del interactoma de las tres especies de Leishmania (L. major, L. braziliensis y L. infantum) permitió identificar proteínas ortólogas presentes en los proteomas de estas tres especies y 256 interacciones conservadas tanto en el alineamiento múltiple como en la red original de cada una de estas tres especies, donde la mayoría de las proteínas que integran estas interacciones conservadas son dineínas de cadena pesada, las cuales participan en procesos como en el movimiento basado en microtúbulos, motilidad ciliar o flagelar y ATP catabólico. Otras proteínas encontradas fueron las metalopeptidasas de zinc dependientes de ATP, las cuales no tienen homología con las del ser humano y son importantes para la supervivencia del amastigote, estadio en el cual se produce la leishmaniasis en el ser humano; razón por la cual se podrían proponer como posibles blancos terapéuticos. Y las proteínas de mantenimiento de minicromosomas (MCM), las cuales hacen parte del proceso biológico de replicación del ADN; sugiriendo a estas tres proteínas como el grupo principal para caracterizar y explorar como dianas terapéuticas.
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Análisis comparativo del genoma de seis aislamientos clínicos de mycobacterium tuberculosis con fármaco resistencia múltiple
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2014, 2014-05) Solano Gutiérrez, Juan Sebastián
Mycobacterium tuberculosis (MTB) es el agente causal de la tuberculosis (TB), una enfermedad presente en un tercio de la población y cuyo control se ve amenazado por la co-infección con el virus de inmunodeficiencia humana (VIH) y el surgimiento de cepas Multidrogo-Resistentes (MDR-TB). Con el fin de aportar información que pueda tener importancia en el control y seguimiento de la enfermedad, el análisis de secuencias nucleotídicas es una herramienta que permite la identificación de cambios en el genoma de distintos aislamientos con el objetivo de realizar una caracterización completa que pueda aportar información de las propiedades patógenas de MTB y pueda servir en estudios de transmisión de TB. En este estudio se realizó el ensamble, anotación y comparación del genoma de seis aislamientos MDR-TB utilizando herramientas bioinformaticas. Se estableció la metodología para la corrección, reconstrucción, anotación y alineamiento múltiple de los seis genomas que permitió encontrar deleciones e inserciones de cada aislamiento en comparación con el genoma de referencia H37Rv, además, se encontraron las regiones específicas de cada aislamiento. Deleciones de la secuencia de inserción IS6110 presentaron número y posición diferente en cada aislamiento y una pérdida de fragmento de 6.480 pb comprendiendo los genes Rv2271 a Rv2279 fue la deleción más importante presente en todos los genomas. Las secuencias únicas sumaron un total de 36 entre todos los genomas y se encontraron distribuidas principalmente en los genes de la familia PPE y PE_PGRS y en regiones intergénicas.
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ANÁLISIS COMPARATIVO DEL GENOMA MITOCONDRIAL DE AVISPAS PARAS ITOIDES Y LA CORRELACIÓN CON SU ESTILO DE VIDA
(Universidad del Tolima, 2023) PARRA CALDERÓN, FREIDY JOHANA; PRADA QUIROGA, CARLOS FERANDO
La diversificación de las formas de parasitar y la evidente evolución molecular en los himenópteros sugiere una posible correlación entre el estilo de vida parasitoide y la tasa de reorganización del genoma mitocondrial. Para identificar las difere ncias en el genoma mitocondrial entre avispas parasíticas y no parasíticas, se llevó a cabo un análisis comparativo de 115 mitogenomas de avispas disponibles en el NCBI National Center for Biotechnology Informatio n)n). Se emplearon herramientas bioinformáticas como Geneious y el servidor web MITOS para verificar las anotaciones génicas y revisar el grado de reorganización de los genomas. Se realizó un diagrama de calor para evidenciar la tasa de reorganización según el estilo de vida y finalment e se construyó una red de interacción para contrastar la relación huésped hospedador y estilo de vida. Se evidenció que el 1 0% de los genomas revisados tienen errores de anotación y la tasa de reorganización para los parasitoides y no parasitoides fue de 7 2% y 32%, respectivamente. Los resultados obtenidos muestran que dependiendo de las estrategias de vida la tasa de reorganización puede cambiar drásticamente , habiendo un incremento en familias con estilos de vida que requieren de mecanismos complejos para asegurar el aprovisionamiento de sus larvas , como el endoparasitoidismo y la fitofagia secundaria Así mismo, se encontró que las avispas que se asocian con tasas de reorganización menores, como los depredadores y los ectoprasitoides, suelen ser generalistas mientras que los de estilos de vida más complejos requieren de una mayor especificidad de huésped. Lo anterior proporciona evidencias suficientes para confirmar la hipótesis que señala a la reorganización del mitogenoma como un fac tor informativo para la comprensión de la evolución del parasitismo en Hi men ó ptera .
Restringido
Análisis de enlaces lineales con perspectivas de conectividad y conservación de avifauna en paisajes fragmentados de bosque seco tropical de la zona centro del departamento del Tolima
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2016, 2016) Gil Noreña, Jonnathan Manuel
En este estudio se caracterizó la comunidad de aves y su asociación con la composición y estructura de la vegetación de enlaces lineales (bosques riparios, cercas vivas y canales de riego arbolados) en un paisaje fragmentado de Bosque Seco Tropical (BST) en seis localidades de la zona centro del departamento del Tolima. Utilizando puntos de conteo, se registró un total de 155 especies (5155 individuos) pertenecientes a 41 familias, y por medio de sistemas de información geográfica (SIG) se diseñaron posibles escenarios de conservación de avifauna para cada localidad; además, se realizaron análisis de diversidad alfa (Shannon-Wiener) y beta (Jaccard) con pruebas de análisis de componentes principales (ACP), regresiones lineales, análisis de varianza (ANAVA) con el fin de determinar correlaciones entre las variables de composición y estructura de la vegetación y la comunidad de aves. La composición avifaunistica y vegetal para los enlaces lineales en cada una de las localidades presentó diferencias significativas. La localidad con mayor diversidad de aves fue Potrerillo (H’=3,76). El enlace lineal con mayor diversidad de aves fue el bosque ripario (H’=4,013). Los enlaces lineales con mayor complejidad en su estructura vertical de la vegetación fueron los canales de riego CRII y CRIII. La estructura vertical de la vegetación se correlacionó fuertemente con el número de individuos de aves (R=0,79) y el número de especies de aves (R=0,72). El modelamiento de costo-distancia con la inclusión de enlaces lineales arrojó una disminución significativa en los valores de desplazamiento hipotético (distancia de recorrido) para aves de categoría Ib en cada ventana de trabajo. Se concluye que el diseño de enlaces lineales como escenarios de conservación incrementa la conectividad estructural de fragmentos asociados a paisajes de BST altamente intervenidos. Palabras clave: Enlaces lineales, fragmentación, conectividad, Bosque Seco Tropical.
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Análisis de las alteraciones del genoma mitocondrial de hexápodos y su impacto en la evolución
(Universidad del Tolima, 2020) Moreno Carmona, Manuela Alejandra
Introducción. La mitocondria cumple un papel fundamental en el metabolismo. Se reportó que el mitogenoma de los insectos es conservado, y si existen reordenamientos solo se presentan en grupos aislados. Por lo tanto, este estudio tiene como objetivo determinar la variabilidad del mitogenoma de Hexapoda y su asociación a procesos adaptativos. Materiales y métodos. Se descargaron 1198 mitogenomas de hexápodos de NCBI. Se verificaron las anotaciones génicas y se revisó el grado de conservación de los genomas. Se realizó una filogenia de reorganizaciones para encontrar posibles convergencias con los programas GRIMM, Unimog y Paup. Se determinó la variabilidad de los tamaños y la identidad entre los órdenes de Dloop. Finalmente, esto se contrastó con procesos adaptativos. Resultados y Discusión. El 9.1% de los genomas tiene errores de anotación y el 48.7% esta reorganizado. Se encontraron convergencias en ordenes distantes y rearreglos específicos en grupos cercanos. Se identificaron errores de anotación del Dloop en el 30% de los genomas y se reporta por primera vez una posible correlación fuertemente negativa entre la identidad y el tamaño del Dloop. Los insectos poseen una alta variabilidad en el mitogenoma, contrario a lo reportado previamente. Posiblemente el estilo de vida parasítico-parasitario, de plagas y vectores, propicia las reorganizaciones por el estrés oxidativo al que están expuestos. Por lo tanto, este es el primer trabajo que reúne los reordenamientos mitocondriales de 32 órdenes de Hexapoda y permite visualizar el alto nivel de reorganización que presentan algunos grupos de insectos ligado a su estilo de vida.
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ANÁLISIS DE PREFERENCIAS ALIMENTICIAS, DIVERSIDAD BACTERIANA Y VIRAL EN POBLACIONES DE Aedes aegypti CIRCULANTES EN EL MUNICIPIO DE IBAGUÉ A TRAVÉS DE METATRANSCRIPTÓMICA
(Universidad del Tolima, 2024) BRIÑEZ ZABALETA, WEIMAR DAVID; URREA MONTES, DANIEL ALFONSO; VALLEJO, GUSTAVO ADOLFO; CARRANZA MARTINEZ, JULIO CESAR
Aedes aegypti, es considerado el principal vector de arbovirus de importancia en salud pública. El estudio e identificación del microbiota del vector (virus, bacterias, hongos y parásitos) es de gran importancia, pues sus interacciones pueden ser relevantes para comprender la capacidad vectorial y efectuar vigilancia y control de estas arbovirosis y otras enfermedades. Este trabajo muestra la identificación de fuentes alimenticias, bacterias y virus circulantes en poblaciones de A. aegypti de la ciudad de Ibagué a través de RNAseq. Se colectaron adultos de A. aegypti procedentes de cuatro comunas de la con alta incidencia para arbovirosis de importancia médica durante la época de pandemia. A partir de pools de 50 hembras/comuna, se realizó RNAseq a través del instrumento Novaseq 6000 con depleción de rRNA. Seguidamente, fueron depurados las lecturas para ser ensambladas de novo con Trinity versión 2.13 (Grabherr et al., 2011). La identificación de preferencias alimenticias, riqueza y abundancia de virus y bacterias se llevó a cabo empleando los programas Blastx y Blastn, Kraken2 y MEGAN6. Se identificaron los hospederos de alimentación para A. aegypti. Se determinaron las familias bacterianas para cada una de las localidades evaluadas y se realizó la comparación de diversidad entre estas. Se identificaron especies virales pertenecientes al vector, de las cuales algunas pueden tener implicaciones en la competencia vectorial como Phasi Charoen-like virus. A. aegypti es un vector altamente antropofílico, sin embargo, también puede alimentarse de pequeños mamíferos, aves y especies de importancia pecuaria. La diversidad bacteriana entre localidades varia en la composición de familias, adicionalmente esta variabilidad parece estar ligada a la alimentación. El viroma central en A. aegypti se encuentra conservado; la prevalencia de arbovirus de importancia en salud pública encontrada en este trabajo fue nula.
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Análisis faunístico de las larvas de insectos del orden trichoptera en la cuenca del río Alvarado, Departamento del Tolima
(2014-08) Duarte Ramos, Edison Jahir
El orden Trichoptera es de gran importancia en la dinámica de los ecosistemas acuáticos ya que constituyen unos de los pilares de la cadena trófica y presentan un rango variable de tolerancia a las condiciones ambientales. Durante dos periodos hidrológicos septiembre y diciembre se desarrolló la colecta de individuos en 9 estaciones a lo largo de la cuenca del rio Alvarado, teniendo en cuenta tramos impactados y no impactados por la urbanización y la agricultura, con el fin de evaluar la composición y estructura de la comunidad de tricópteros y aspectos referentes a la ecología, distribución espacial y temporal de sus comunidades en esta cuenca. La colecta de organismos se realizó con red Surber, en diferentes sustratos (roca, arena, grava-guijarro y hojarasca). Se registraron datos in situ de velocidad, temperatura ambiente y del agua, pH y oxígeno disuelto en el agua, además se tomaron muestras de agua para análisis fisicoquímicos en el Laboratorio de aguas de la Universidad del Tolima (LASEREX). Se colectaron 1234 especímenes, correspondientes a 8 familias y 17 géneros. La familia Hydropsychidae registró la mayor abundancia (60,6%), mientras que las familias menos representativas fueron Glossosomatidae (1.1%) e Hydrobiosidae (0.1%). Los géneros más abundantes fueron Smicridea (51.5%), Hydroptila (11,3%), y Leptonema (9.1%), Atopsyche (0.1%) presentó la menor abundancia. Respecto a la distribución espacial Leptonema y Smicridea se registraron en las 9 estaciones evaluadas, desde 351 a 1057 msnm, registrándose en un amplio rango, mientras que Atopsyche (1057 msnm), Protoptila (574 msnm) y Zumatrichia (977 msnm) presentaron un rango altitudinal restringido. Temporalmente se presentó mayor abundancia de organismos en el mes de septiembre (pico de lluvias) (60.1%), siendo la familia Hydropsychidae la más dominante en ambos periodos de muestreo. De otra parte, con relación a los sustrato se encontró que grava presentó mayor porcentaje de organismos (37.7%), mientras que arena el menor (12%). De las 9 estaciones evaluadas, Quebrada Chumba reveló la mayor diversidad (1.82 H´), Rio Alvarado Chucuni (0.57 H´) la menor. La mayor riqueza de Margalef se registró en la Quebrada Cocare (D’=2.41) y la menor en Río Alvarado Chucuni (D’=0.72). El análisis de similitud (Jaccard) define el grupo con mayor similitud al conformado por Quebrada la Chumba y Cocare (70 %), por otro lado la Quebrada Chembe presentó el mayor grado de disimilitud con 35%. El análisis de correspondencia canónica permitió visualizar la relación existente entre algunos géneros de tricópteros con las estaciones de muestreo y las variables fisicoquímicas evaluadas en la cuenca del río Alvarado. Se observa que en las estaciones Rio Alvarado Chucuni y Puente el género Protoptila está asociado con las variables fosfatos y DQO; los géneros Hydroptila y Mortoniella se encuentran próximos a las estaciones Rio Alvarado Caldas Viejo y Quebrada La Caima y están influenciados por las variables oxígeno disuelto, velocidad media, alcalinidad y pH.
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ANÁLISIS FLORÍSTICO DE LA VEGETACIÓN LEÑOSA DE UN BOSQUE SUBANDINO EN LA VERTIENTE OCCIDENTAL DE LA CORDILLERA ORIENTAL DEL ALTO MAGDALENA.
(Universidad del Tolima, 2021) RIVAS SALAS, GUILLERMO; VILLANUEVA TAMAYO, BORIS
Se realizó el análisis florístico de la vegetación leñosa de dos bosques sub-andinos en el alto Magdalena, nombrados Rio Naranjo (RN) y Campo hermoso (CH), localizados en el municipio de Villarrica-Tolima, por medio del establecimiento de una parcela permanente cuadrada (PPC) de 1ha (100x100m) en cada bosque. Donde se obtuvieron de cada morfotipo colectas botánicas y de cada individuo los datos correspondientes a su identidad y al DAP en el POM≥10cm. Las plantas fueron determinadas al taxon más específico posible y se realizaron cálculos a partir de los datos dasométricos y demográficos para describir los patrones que definen las comunidades estudiadas desde su estructura y composición. De igual manera se estimó la riqueza usando estimadores no paramétricos y la diversidad de cada sitio usando el índice de Simpson, Shannon, Margalef y números de Hill. Esta información también se usó como insumo para realizar comparaciones entre las comunidades y así aportar a la discusión referente a la betadiversidad en estos bosques. Se encontraron 61 especies en total, 16 especies en común para CH y RN, 22 especies exclusivas para RN y 23 para CH. diez especies raras para RN y seis en CH. las comunidades evaluadas son altamente contrastantes a pesar de estar en la misma zona de vida, a una distancia menor a 3 km y con una riqueza que solo difiere en un individuo. Posiblemente estas diferencias estén dadas por eventos estocásticos, la dinámica biogeográfica de las especies de los andes y la gran variedad de ambientes generados.
Acceso abierto
Análisis genómico comparativo de las cepas de Helicobacter pylori: evidencia evolutiva de su patogenicidad
(Universidad del Tolima, 2020) Rodríguez Guzmán, Aura María
Helicobacter pylori es una bacteria patogénica que coloniza el tracto gastrointestinal del estómago humano; causante de enfermedades como gastritis, úlcera péptica, linfoma gástrico (MALT) y cáncer gástrico, con mayor prevalencia en países subdesarrollados. Su gran diversidad genética es causada por una alta tasa de mutaciones, observándose variaciones en los factores de virulencia en los diferentes linajes filogeográficos. Este proyecto tuvo como objetivo, postular los eventos de evolución en los genes asociados a factores de virulencia presentes en las cepas de Helicobacter pylori, con el fin de identificar la relación de estos genes con su origen filogeográfico. Se analizaron por medio de herramientas bioinformáticas, los genomas completos de 135 cepas disponibles en NCBI, de diferentes orígenes poblacionales, identificando eventos de reorganización génica en 87 genes de factores de virulencia, divididos en 7 grupos funcionales, para así, determinar cambios en la posición, número de copias, identidad nucleotídica y tamaño, contrastándolos con su linaje geográfico y fenotipo patogénico. Como resultado se demuestran que no hay una relación directa entre el nivel de reorganización con el linaje geográfico. Sin embargo, si se puede evidenciar una relación en el fenotipo patogénico demostrada en el análisis de número de copias, tamaño y similitud al dividirse las cepas que poseen y no las citotoxinas cagPAI teniendo mayor riesgo de desarrollar gastritis y úlcera péptica. Estudios evidencian el impacto funcional y patogénico de las reorganizaciones en cepas de bacterias patogénicas, pero solo en algunos factores de virulencia de mayor interés como cag y vacA.
Sólo datos
Análisis molecular de genes adaptativos en Drosophila martensis, Drosophila starmeri y Drosophila Uniseta del grupo repleta, en dos poblaciones aisladas
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2018, 2018) Moncada Jiménez, Juan Felipe; Sierra Ramírez, Diego
La evidencia de variaciones genéticas y procesos adaptativas dentro de una especie, como resultado del aislamiento generado por múltiples barreras, que reducen drásticamente el flujo genético entre las poblaciones, es el evento central en la evolución de las especies biológicas. El gen del glutatión S-transferasa D1 (GstD1) y los genes de la proteína de la glándula accesoria masculina (Acp’s) han sido implicados en la adaptación a ambiente xerofíticos con alta abundancia de Cactaceaeas y en la selección sexual o conflicto sexual en Drosophila, respectivamente. Las especies del enjambre martensis, pertenecientes al grupo repleta, se encuentran en dos ambientes áridos colombianos aislados por más de 1200 km; con variaciones morfológicas y cromosómicas observadas entre estas dos poblaciones. El objetivo de este trabajo fue determinar la variabilidad molecular de tres genes asociados a procesos adaptativos y el marcador COI en tres especies del enjambre martensis recolectadas en poblaciones de dos ecosistemas colombianos aislados. Fueron realizados análisis de evolución genética y molecular de dos genes Acp’s (Acp32CD y mfas), genes GstD1 y COI de 83 moscas de las tres especies de enjambres de martensis de dos poblaciones aisladas. Nosotros observamos fuerte evidencia de divergencia genética y selección adaptativa en todos los marcadores genéticos entre poblaciones de las especies del enjambre martensis. Asimismo, de cada una de las especies analizadas, se observaron diferentes valores de selección entre las dos localidades aisladas. De igual manera, en los análisis de redes filogenéticas y de haplotipos, se confirma una estructura poblacional entre las poblaciones aisladas de la Costa norte y Tatacoa. Los resultados moleculares encontrados en este proyecto concuerdan con trabajos previos que han sugerido la formación de razas geográficas a partir de diferencias interpoblacionales en las especies del enjambre martensis. Palabras clave: Enjambre martensis, Genes adaptativos, Filogenias moleculares, Diferencia poblacional, Aislamiento geográfico.
Acceso abierto
Aprovechamiento integral de la semilla de Mangifera indica L. de cuatro variedades cultivadas en el departamento del Tolima
(Ibagué : Universidad del Tolima, 2018, 2018) Ávila Rodríguez, Yalile Consuelo; Villanueva Báez, Paula Xiomara
Durante la etapa de postcosecha del cultivo de mango, se generan diferentes residuos que no se aprovechan, ente ellos la semilla. Una de las alternativas para darle valor agregado, es la identificación de compuestos que puedan ser usados en diferentes áreas tales como la alimentaria y farmacéutica. Por lo tanto, esta investigación determinó las propiedades fisicoquímicas, contenido de ácidos grasos, de compuestos fenólicos, flavonoides, actividad antimicrobiana y antioxidante de los extractos hexánicos y etanólicos provenientes de la almendra de la semilla de cuatro variedades de mango (Mariquiteño, Manzano, Común y Yulima). Se estableció la importancia de la biomasa residual como sustrato para el crecimiento de las cepas de los hongos comestibles Lentinus crinitus y Pleurotus tubarius. Los resultados indicaron que las variedades estudiadas presentaron en su perfil de ácidos de grasos una mayor proporción de ácido oleico; contenido de fenoles de 103 a 125 mg EAG/g de peso seco (EQG: equivalentes de Acido gálico) destacándose por primera vez la presencia de procianidina B1, así como un contenido de flavonoides entre 0.72 a 0.8 mg EQ/g de peso seco (EQ: equivalentes de quercetina). La actividad antioxidante de los extractos frente a los radicales ABTS y DPPH, mostraron valores de CI50 entre 3.09 y 3.42 μg/mL para el ABTS y 12.17 a 13.93 μg/mL para el DPPH. Los datos obtenidos muestran el potencial que tienen la almendra de las cuatro variedades, compuestos con bioactividades importantes, plantean una alternativa para su aprovechamiento en varios sectores de la industria y el uso integral de este residuo agrícola. Palabras clave: Núcleo semilla de mango, Polifenoles, antioxidante, flavonoides, antimicrobiana, ácidos grasos, hongos comestibles

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