AEA. Tesis y Trabajos de Grado
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- PublicaciónRestringidoÁcidos grasos como marcadores quimiotaxonómicos del zooplancton superficial de bahía Málaga, pacífico colombiano(Ibagué: Universidad del Tolima, 2011., 2011) Gutiérrez, Carolina; Reinoso Floréz, Gladys (Directora); Méndez, Jonh Jairo (Asesor); Eras Joli, Jordi (Asesor)La importancia del zooplancton en los ecosistemas acuáticos es inmensa, y radica en su estatus en las cadenas tróficas de este ecosistema. De esta forma, invertebrados, peces e incluso mamíferos de gran tamaño, como algunas especies de ballenas, son animales zooplanctívoros. Por ello, una de las formas adecuadas para estudiar algunos aspectos ecológicos de esos individuos, puede ser a través del conocimiento de su presa, es decir de los organismos que constituyen el zooplancton. Sin embargo, el estudio de estos organismos microscópicos es complejo y engorroso; por lo cual la aplicación de nuevas técnicas (como el análisis de ácidos grasos), podría facilitar la comprensión de algunos aspectos ecológicos y bioquímicos de esta comunidad. Por ello, la importancia de este estudio radica en la posibilidad de explorar técnicas novedosas aplicadas a los estudios en taxonomía del zooplancton. De esta forma, se ha analizado la composición de ácidos grasos como marcadores quimiotaxonómicos, en los organismos colectados, al tiempo que se han aplicado las técnicas de microscopia para el conocimiento de las especies. Así, la correlación y comparación de las dos técnicas ha generado una información importante sobre este novedoso método, y así facilitar la difícil tarea de conocer la composición taxonómica del plancton superficial en las aguas oceánicas colombianas. A través del protocolo de extracción de ácidos grasos aplicado, se pudo inferir que existe una mayor disponibilidad de biomasa zooplanctónica viva, en las estaciones ubicadas en la parte externa de la bahía, lo que se convierte en un indicativo de mayor densidad de zoopláncteres en las zonas más distantes de la costa. Además, el análisis del rendimiento de las fracciones lipídicas (fosfolípidos y lípidos neutros) en las estaciones evaluadas, indicó prevalencia de organismos viables para los análisis de ácidos grasos, ya que en la mayor parte de la estaciones, se obtuvo un mayor rendimiento en la fracción fosfolipídica. Los ácidos grasos más abundantes del zooplancton superficial de bahía Málaga fueron: ácido Palmítico (C16:0), ácido Oléico (C18:1 (c9)-ω9) y CLA - ácido Linoléico conjugado (C18:2 (c9, t12)), de los cuales el ácido Palmítico (C16:0) se asocia comúnmente con la presencia de organismos de la subclase Copepoda, el cual fue el taxón más abundante para este estudio, confirmando así su valor como marcador de este taxón. Sin embargo, a nivel de phylum, no se observó ninguna asociación de los ácidos grasos que pudiera indicar uso importante como marcador quimiotaxonómico a través de las herramientas de análisis usadas en este estudio. Sin embargo, a nivel de clase se presentó una asociación de Sagittoidea con los ácidos C20:2 (c11,14)-(ω6) y C20:3(ω3)+C20:4(ω6), indicando que para este taxón los derivados del ácido Araquídico se convierten en una herramienta quimiotaxonómica útil. De forma general, se determinó que los ácidos grasos son una herramienta útil, no solamente para determinar grupos taxonómicos en el zooplancton superficial bajo las condiciones de este estudio, sino que se convierte en un tema de investigación importante para dilucidar relaciones tróficas en los ecosistemas acuáticos.
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis de los cantos de Thamnophilus doliatus, Troglodytes aedon y Saltator striatipectus en gradientes de ruido en bosque premontano en el centro y norte del Tolima(Ibagué : Universidad del Tolima, 2016, 2016) Pacheco Vargas, Gustavo FabiánEl canto es una señal utilizada en la comunicación y busca modificar el comportamiento del individuo que la recibe. Estas señales tienen como función el reconocimiento de individuos, la defensa del territorio y la selección sexual. Desde que se planteó la “Hipótesis de la adaptación acústica” se han venido investigando las causas de la variación en el canto, al comienzo se encontró como fuente de variación la estructura del hábitat y recientemente se descubrió que la intervención antrópica es un factor que provoca variaciones en las vocalizaciones. El objetivo de esta investigación fue analizar los cantos Thamnophilus doliatus, Troglodytes aedon y Saltator striatipectus en gradientes de ruido en bosque premontano en el centro y norte del Tolima. Se realizaron grabaciones y medición de ruido en cinco puntos a lo largo de un transecto, cada punto estuvo separado del otro por 100 m. En cada punto se hicieron grabaciones de tres minutos, en una franja horaria entre las 06:00-17:00. Se tuvieron en cuenta las siguientes variables: duración del canto, número de notas, frecuencia mínima, frecuencia máxima, rango de frecuencia y la tasa de canto. Para determinar diferencias en los tratamientos de ruido se realizó un ANOVA. Se aplicaron Modelos Lineales Generales y Mixtos para todas las variables. El mejor modelo se determinó por el Criterio de Información Akaike. Se encontró que la estructura temporal del canto de la especie Saltator striatipectus varía a través del gradiente de ruido, el canto de las otras dos especies no presentó variación ente este factor.
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis genético del carcinoma de tiroides en una muestra de pacientes colombianos(Ibagué : Universidad del Tolima, 2015, 2015-08) Estrada Florez, Ana PatriciaEl carcinoma de tiroides (CT) es la neoplasia más común del sistema endocrino y su incidencia en Colombia se ha incrementado en los últimos años. El cáncer es una enfermedad genética, esporádica o hereditaria, que puede desencadenarse por interacción de factores genéticos y ambientales. Diversos estudios epidemiológicos, han mostrado una relación entre el riesgo de padecer CT y el impacto de factores externos como: el estrato socioeconómico, el nivel educativo y el consumo de alcohol y cigarrillo. De otra parte, dado que existe una mayor incidencia en el género femenino, se ha planteado la posibilidad de encontrar diferencias de tipo hormonal, entre casos y controles sanos, evaluando factores como la planificación hormonal, la edad de la menarquia y menopausia, el número de hijos nacidos vivos y la lactancia. Teniendo en cuenta lo anterior, en el presente estudio, se analizaron dichos factores a partir de las entrevistas de 253 pacientes, pareados por género y lugar de procedencia, con controles sanos, mayores de 50 años y sin antecedentes familiares de cáncer en primer y segundo grado de consanguineidad. Se evidenció una mayor ocurrencia de cáncer de tiroides en las mujeres que en los hombres, con una relación de 8:1; el carcinoma papilar fue el más frecuente (93,5%), seguido por el folicular (5,9%) y medular (<1%). La edad promedio de diagnóstico fue de 46 años en casos con carcinoma papilar de tiroides (PTC, por sus siglas en inglés), y de 45 años en hombres y 60 años en mujeres con carcinoma folicular de tiroides (FTC, por sus siglas en inglés). El análisis del riesgo mediante el cálculo de Odds ratio (OR), reveló que existe un incremento significativo en el riesgo de padecer la enfermedad en pacientes de estrato socioeconómico medio-alto y el nivel de escolaridad superior, además, se presentó un incremento del riesgo en los casos que presentaron menarquia temprana, planificación hormonal y menopausia no funcional. 17 De otra parte, en cuatro análisis GWAs de pacientes de Europa y Asia, se ha reportado el incremento de la susceptibilidad en personas con el alelo de riesgo para los polimorfismos de los SNPs: rs1867277, rs965513, rs944289, rs116909374, rs2439302, rs966423 y rs6983267, y considerando que no han sido estudiados en poblaciones de América del Sur, se realizó la genotipificación alelo especifica de estos polimorfismos, usando el sistema KASPAR. A partir de los genotipos obtenidos, se realizaron pruebas de equilibrio de Hardy Weingber (HW) y de asociación en el programa Plink, encontrándose que todos presentan un incremento significativo del riesgo, a excepción del rs966423, que no cumplió con el equilibrio de HW, por lo tanto, no se incluyó en los cálculos de OR individuales y combinados. El análisis combinado de los SNPs rs965513, rs944289, rs116909374, rs2439302 y rs6983267, reveló estar relacionados con una probabilidad tres veces superior en los portadores de 7 o más alelos riesgo. La mayor parte de los diagnósticos actuales no son concluyentes, pues se basan en la aspiración por aguja delgada (BACAF). Afortunadamente, ha tomado fuerza el diagnóstico molecular, basado en el análisis de mutaciones en genes como BRAF, asociados con el desarrollo, mal pronóstico, recurrencia, metástasis de la enfermedad y respuesta a tratamientos pre y post quirúrgicos. Por esta razón, se amplificó y secuenció el exón 15 del gen BRAF, en el ADN de 164 muestras de tejido tumoral tiroideo, encontrándose que la mutación V600E, se presentó en el 55% de las muestras de PTC, sin variaciones entre género y edad de diagnóstico, pero con una mayor frecuencia en casos con complicaciones como lesiones bilaterales, mayores a 1cm y con metástasis a ganglios linfáticos. Adicionalmente, se realizó la detección por PCR aleloespecifica de esta mutación en muestras de sangre de 239 pacientes, las cuales fueron homocigotas para el alelo silvestres en su totalidad, confirmando la naturaleza esporádica y especificidad de la mutación V600E en este tipo histológico.
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis genético del mestizaje y su relación con el carcinoma de glándula mamaria en dos grupos de mujeres del Tolima y Huila(Ibagué : Universidad del Tolima, 2015, 2015) Ramírez Alfonso, CarolinaLas tasas de incidencia, prevalencia y mortalidad de mujeres con carcinoma de glándula mamaria (CGM), hacen de esta patología la más frecuente en mujeres en todo el mundo, perfilándose como un problema de salud pública (Globocan 2012). Las desigualdades en la incidencia y prevalencia del CGM en los diferentes grupos étnicos o entre una misma población, pueden atribuirse no sólo a factores de riesgo modificables - ambientales - sino, además, a factores genéticos que pueden ser de origen somático o germinal. Investigaciones previas realizadas en mujeres en EE.UU (por sus siglas en inglés Estados Unidos), han sugerido que el componente étnico/ heredable, podría desempeñar un papel importante como factor de riesgo o de protección, frente al eventual desarrollo de la enfermedad. En este trabajo, se realizó un estudio tipo caso y control, en 203 mujeres mestizas diagnosticadas con CGM y 205 mujeres mestizas, sanas, provenientes de los departamentos del Tolima y Huila, con el fin de determinar la relación entre el ancestro –inferido a través un set de 18 marcadores autosómicos y las frecuencias de los haplogrupos mtDNA (A, B, C y D)-, los factores de riesgo ambientales y la susceptibilidad a desarrollar CGM. La asociación entre los factores de riesgo ambientales y el riesgo a desarrollar CGM fue evaluada a partir de variables categóricas utilizando pruebas de X2 y el test exacto de Fisher, las variables continuas se evaluaron con la prueba t de Student. La asociación entre el riesgo a desarrollar CGM y la ancestría genética, fue determinada a partir del modelo de regresión logística (binaria, multivariada), ajustada y sin ajustar por factores de riesgo ambientales. En la población analizada, la contribución de los 4 linajes del mtDNA, fundadores de las poblaciones amerindias (A, B, C y D), se encuentran presente en un 90%, mientras que las frecuencias genotípicas de los marcadores autosómicos (SNPs), indican una contribución del 50.46% europea, de 36.16% amerindia y 13.36% africana. Tener hábitos de consumo de alcohol y el uso de anticonceptivos hormonales presentó asociaciones significativas con el aumento del riesgo a desarrollar el cáncer de seno. Mientras que una menarquia tardía y una paridad mayor a 6 hijos confiere una protección frente al riesgo de padecer la enfermedad. No se encontró evidencia de asociación estadística entre la ancestría genética y el riesgo a desarrollar CGM, aunque, después de ser ajustada por algunas variables de estilo de vida y reproductivos (consumo de alcohol, edad media de la menarquia, planificación hormonal y una mayor paridad), se evidenció un ligera asociación de la ancestría europea frente al riesgo (OR= 1.02; IC 95% 1.002 -1.045, p=0.030).
- PublicaciónRestringidoAnálisis genético molecular en tumores colorrectales de pacientes tolimenses(Ibagué : Universidad del Tolima, 2009, 2009) Flórez Delgado, Nancy Yaneth
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis genético y clínico patológico del carcinoma gástrico en una muestra de pacientes colombianos(Ibagué : Universidad del Tolima, 2016, 2016) Suarez Olaya, John JairoEl cáncer gástrico (CG), es la tercera causa principal de muerte en el mundo, siendo la primera de ellas para los hombres colombianos y la tercera en las mujeres. Aunque se plantea que aproximadamente en el 10% de los casos se observa agregación familiar, sólo entre un 1% y un 3% puede explicarse por mutaciones germinales en el gen de alta penetancia CDH1. En diversos estudios epidemiológicos, se han encontrado factores de riesgo asociados con la susceptibilidad a desarrollar este tipo de cáncer; entre ellos se cuentan: el estilo de vida, el consumo de tabaco y el de alcohol, la alimentación y algunos aspectos infecciosos relacionados con la presencia del virus Epstein – Barr (EBV) y la bacteria Helicobacter pylori (H. pylori), no obstante, para otros como el índice de masa corporal (IMC) y algunas características ginecológicas, su asociación sigue en discusión. Con base en lo anterior, en el presente estudio, se analizaron dichos factores, además del cuadro clínico-patológico de 143 pacientes con CG colombianos, pareados por género y lugar de procedencia, con 164 controles mayores de 50 años, sin historia personal o familiar de cáncer. Los resultados mostraron que esta enfermedad es más frecuente en hombres que en mujeres (1,69:1). El porcentaje de los casos mayores de 50 años, fue del 75,53% y la edad media del diagnóstico, 62 años en ambos sexos. Para los casos jóvenes (<50 años), el porcentaje fue de 24,47%, y los promedios de edad fueron de 39 y 40 años para hombres y mujeres respectivamente. Según la clasificación de Lauren, el cáncer gástrico intestinal (CGI), fue el más frecuente (45,4%), seguido del CG difuso (CGD) (39,4%), y del mixto (CGM) (15,2%). El CGD fue más alto que en los reportes anteriores (5%-15%). En hombres, el mayor riesgo de CG se asocia con estratos socio-económicos y educativos bajos, consumo de alcohol y cigarrillo, antecedentes de trastornos respiratorios, endocrinos y factores infecciosos. El 57,1% de los casos fueron diagnosticados con CGI, localizado en la parte distal del estómago en estado avanzado y presencia de glándulas mal diferenciadas. En mujeres, el aumento del riesgo se asoció con el consumo de bebidas alcohólicas, tabaquismo activo y/o pasivo y el consumo de anticonceptivos hormonales. Las pacientes jóvenes (<50 años), presentaron mayor porcentaje de CGD, localizado en su mayoría en el estómago distal y con tumores en estados avanzados (TNM III y IV), y pobremente diferenciados. El 24,8% de los pacientes presentó antecedentes familiares de CG y el 35,9% tenía parientes en primero o segundo grado de consanguinidad, afectados por otros tipos de cáncer. El cáncer colón-rectal, fue la segunda neoplasia más frecuente en los miembros de las familias. De otra parte, en países occidentales, el riesgo a desarrollar lesiones gástricas se ha explicado por mutaciones en genes de alta penetrancia -CDH1 y TP53- y penetrancia moderada -hMLH1, PSCA, FAT4, ARID1A, CTNNB1, CYP2E1, CYP26B1 y MUC1-. En Colombia, son escasos los estudios que correlacionen la susceptibilidad a desarrollar CG en personas con el alelo de riesgo para los polimorfismos de los SNPs: rs12155758 (PSCA), rs4072037, rs2070803 (MUC1), rs3813867, rs2031920 (CYP2E1), rs707718, rs2286965, rs2241057 y rs3768641 (CYP26B1). En este trabajo, se realizó la discriminación alélica de estos polimorfismos, mediante PCR alelo-específica competitiva, usando el sistema KASP (LGC Genomics). A partir de los genotipos obtenidos, se realizó el análisis de riesgo para los portadores de los genotipos susceptibles, en el programa Plink 1.07, encontrándose -en hombres- que los SNPs rs4072037 y rs3813867, se asocian con un aumento del riesgo a desarrollar CGI y con la aparición y progresión del tumor. El rs12155758, se asoció con el incremento del riesgo de CGD y con las características del tumor. Para los SNPs rs2070803 y rs2031920, se registró asociación con la disminución del riesgo de desarrollar CGI en hombres, incluyendo las etapas iniciales del tumor. El análisis combinado de los SNPs rs4072037, rs3768641, rs3813867 y rs12155758, reveló que ser portador de entre seis y ocho alelos mutados, representa una asociación con el riesgo cuyo OR es de 6.02 (IC95% 2,23-16,24; P=0,0002); los individuos sanos, portadores de dos alelos mutados de los SNPs rs2031920 y rs2070803, mostraron una asociación con la disminución del riesgo con un OR de 0.31 (IC95% 0.16-0.60; P=0.0003). La comparación de las frecuencias registradas para los alelos de riesgo de la muestra, con las respectivas, del proyecto 1000 genomas para cinco poblaciones de referencia -Africana, Americana, Europea, Sur y Este de Asia-, evidenció que la presencia de los alelos C del SNP rs3813867 y A del rs12155758, fue mayor en los pacientes, lo cual refleja las diferencias ancestrales entre las poblaciones y la posible asociación de las mutaciones con el aumento del riesgo de desarrollar la enfermedad en la población colombiana. De otra parte, las frecuencias de los alelos A del rs4072037, A del rs2070803 y T del rs2031920, fueron similares a la de la población del Este de Asia, lo cual identifica, el origen asiático ancestral compartido a las nativas nuestras. Los resultados encontrados en este estudio, indican que las mutaciones especificas en algunos genes relacionados con la susceptibilidad de riesgo en el desarrollo de CG, especialmente de tipo intestinal y difuso y las interacciones con algunos factores clínico-patológicos estudiados, se asocian con el riesgo a desarrollar la enfermedad, lo cual podría explicar, en parte, la aparición del CG en la población colombiana.
- PublicaciónRestringidoAnálisis morfométrico de cuatro especies del grupo repleta: d. Martensis , d. Starmeri, d. Uniseta y d. Aldrichi de dos ecosistemas semiáridos, desierto de la tatacoa y costa norte Colombiana.(Ibagué: Universidad del Tolima, 2008., 2008) Prieto Sánchez, Rodrigo; Echeverry De Polanco, María Magdalena (Directora)Dentro de los supuestos de la teoría de especiación geográfica de Mayr (1942), es plausible considerar que el aislamiento físico de las poblaciones permite la acumulación de variación genética, parte de la cual puede manifestarse a nivel fenotípico, en caracteres cuya importancia evolutiva ha sido previamente evaluada en insectos, como son la forma de las alas, la pigmentación abdominal y el número de pecas toráxicas. En el presente estudio se escogieron estos mismos caracteres, de evolución rápida, para primero evaluar en poblaciones geográficamente aisladas de las especies del grupo repleta: D. martensis, D. starmeri y D. uniseta (Cluster martensis), si este aislamiento, aunado a la heterogeneidad ambiental, ha permitido el avance de un proceso de formación de razas geográficas, que sea evidente a este nivel fenotípico. Así mismo, el hecho de que las especies problema se encuentren en simpatria y que adicionalmente se consideren crípticas o sinmórficas sugiere la existencia de divergencia genética y morfológica que por simple inspección no se determina, pero sin lugar a duda real, importante en las interacciones competitivas y de selección sexual. Como segunda medida se comparó la variación fenotípica encontrada en las especies del cluster martensis con D. aldrichi perteneciente al cluster mulleri, con el propósito de ampliar el conocimiento de la relación evolutiva entre estas especies. La problemática anteriormente mencionada fue abordada mediante la digitalización del contorno de las manchas abdominales y del ala derecha con descriptores de Fourier elípticos y análisis canónicos multivariados. Adicionalmente se realizó el análisis morfométrico tradicional del número de manchas del mesonotum, en las cuatro especies problema las cuales fueron colectadas en las poblaciones de Riohacha, Santa Marta (Costa Norte) y Rosalía en el Desierto de la Tatacoa (Huila). Los resultados mostraron diferencias significativas en la forma de la mancha del tercer segmento abdominal y el ala derecha en las cuatro especies analizadas. Todas las especies mantienen su identidad taxonómica, manifestando diferencias estadísticas entre si. La comparación en cada una de las poblaciones con respecto a la forma de la mancha abdominal permite determinar la existencia de una forma primitiva común a todas las especies y otra derivada que las discrimina. La variación particular encontrada entre las poblaciones de las especies del cluster martensis de la Costa Norte y el Desierto de la Tatacoa, indica que son especies politipicas. Así mismo, al interior de las poblaciones se determinó la existencia de polimorfismos propios que se relacionan con la independencia evolutiva de estas. Si se tiene en cuenta que la variación morfológica suele ser un reflejo de la diferente arquitectura genética y de los procesos microevolutivos que se pueden estar dando de manera particular en las poblaciones y, que el origen de los 16 mecanismos de aislamiento necesarios en la formación de nuevas especies se halla generalmente asociado con la diversificación morfológica y ecológica de las poblaciones, los resultados de este trabajo y otros antecedentes a diferentes niveles de análisis, apoyan la posible existencia de razas y por tanto indicio de un proceso incipiente de especiación. Finalmente la comparación de D. aldrichi con las tres especies del cluster martensis (D. martensis, D. starmeri y D. uniseta) mostró, en algunos casos, la sobreposición de los datos de esta con D. martensis confirmando la posibilidad de que exista una relación filogenética más cercana entre estas dos especies, que entre D. martensis con cualquiera de las otras de su mismo cluster, coincidiendo con lo propuesto por De Polanco et al, en prensa, con base en el análisis morfométrico de la genitalia de los machos en las mismas especies.
- PublicaciónSólo datosAspectos reproductivos y biología pesquera del bocachico Prochilodus magdalenae Steindachner, 1879 en el bajo Atrato, Colombia(Ibagué : Universidad del Tolima, 2018, 2018) Roa Cubillos, Margarita MaríaProchilodus magdalenae ha sido históricamente una de las fuentes de alimento de mayor importancia para la población colombiana; esta especie endémica ha representado más del 50% del volumen de capturas en las principales cuencas trasandinas del país. El aislamiento de la población de P. magdalenae en la cuenca del Atrato, hace necesario que se establezcan medidas de conservación de acuerdo a las características ecológicas y reproductivas de la especie. Se registró información biométrica de capturas provenientes de la pesca artesanal de tres localidades de la cuenca baja del río Atrato, desde enero hasta diciembre de 2014, de un total de 3881 individuos de los cuales 2639 fueron hembras, 1185 machos y 57 indeterminados. La distribución de las tallas, para las hembras estuvo entre los 18.0 y 47.0 cm LE y para los machos entre los 18.0 - 41.5 cm LE. El análisis longitud-peso indicó un crecimiento isométrico para las hembras y alométrico negativo para los machos. La talla media de madurez (TMM) varió entre localidades, pero la análisis histológico indica un valor promedio de 35.5 cm LE para la población total. La época de mayor actividad reproductiva se estimó entre septiembreabril. La distribución de las tallas y la talla media de madurez (TMM), así como las épocas de reproducción, difieren de las reportadas para las zonas baja y media del Atrato, así como para las otras cuencas trasandinas. Se sugiere que hay migraciones parciales para la especie. Palabras Claves: Biología reproductiva, biología pesquera, relación longitud – peso, fecundidad, histología
- PublicaciónRestringidoBiodiversidad de colémbolos en un sistema silvopastoril de tres edades de establecimiento y un área arrocera del bosque seco tropical, en el municipio de piedras, Tolima(Ibagué: Universidad del Tolima, 2008., 2008) Guzmán del Río, Claudia Lisana; Lozano Tovar, María Denis (Directora); Melo Cruz, Omar Aurelio (Director)El presente estudio, se realizó con el fin de contribuir al conocimiento de colémbolos, en el bosque seco tropical (bs –T). El área de trabajo, correspondió a un sistema silvopastoril de tres edades de establecimiento y un área arrocera, ubicados a 4° 29’ 6’’ L.N y 74° 59’ 15’’ L.O. Hacienda El Chaco (Piedras -Tolima). Se establecieron parcelas de 1 hectárea para cada zona de estudio, en cada bloque se trazó una parcela central de 50 x 20m, tomando 320 muestras (8 muestras por sistema, durante 10 meses) con un nucleador o barreno y procesadas en embudos de Berlese – tullgren. Los 11.448 colémbolos capturados, comprenden 10 familias, 16 géneros y 17 morfoespecies. El sistema silvopastoril de 8 años fue el de mayor abundancia y densidad, y el de menor número de organismos el cultivo de arroz, explicable por las prácticas de manejo del cultivo. Se encontró un grupo de doce morfoespecies comunes a todos los sistemas y las morfoespecies Xenilla sp., Cyphoderus sp., Isotoma sp. y Mesaphorura sp., asociadas al sistema silvopastoril y Lepidocyrtus sp., exclusivo para el cultivo. Se presentó una alta dominancia, favorecida por un elevado número de organismos Isotomidos. La abundancia de géneros, mostró diferencias significativas entre los sistemas y los meses de colecta. El análisis de correspondencia y la clasificación jerárquica, mostraron separación de poblaciones, los sistemas con mayor cobertura vegetal (silvopastoril 3 y 8 años), presentan mayor similaridad faunistica, y las comunidades más degradadas y con menor cobertura (arroz y silvopastoril 7 meses), son cercanas.
- PublicaciónAcceso abiertoCaracterización molecular de la variación genética en cuatro etnias indígenas(Ibague : Universidad del Tolima, 2012., 2012-12) Criollo Rayo, Angel AlexandroLas poblaciones colombianas humanas modernas poseen una estructura genética compleja debido a la mezcla amerindia, europea y africana, ocurrida en diferentes proporciones a lo largo del país. En el Tolima se desarrolló un estudio genético para caracterizar las tres ancestrías mencionadas, comparándolas con otra población localizada en la Costa Caribe (Córdoba). Se obtuvo ADN a partir de muestras de sangre tomadas en personas indígenas y no-indígenas procedentes de ambas regiones, para tipificar 6 haplogrupos del ADN mitocondrial (mDNA), 17 del cromosoma Y (NRY) y 100 SNPs autosómicos (AIMs) con el fin de estimar las proporciones de ancestría genética. Los indigenas del Tolima Nasa y Pijao fueron predominatemente de origen amerindio (AIMs: 91%, mDNA: 96%, NRY: 71%), mientras que los individuos mezclados no nativos presentaron principalmente un origen paterno europeo (NRY) del 70%, materno amerindio (mDNA) del 93%, y proporciones de ancestría autosómica europea del 49% y amerindia del 45% en promedio (origen biparental). Por otra parte, los indígenas Embera de Córdoba presentaron proporciones similares a los del Tolima (origen principalmente uniparental), en tanto que los Zenu mostraron proporciones similares con los individuos mezclados de la misma región: ancestría europea (AIMs: 42%, NRY: 67%), amerindia (AIMs: 35%, NRY: 10%, mDNA: 60%) and africana (AIMs: 23%, NRY: 24%, mDNA: 13%) (triparental). Los resultados sugieren que la muestra poblacional global está genéticamente estructurada, lo cual puede deberse a diferencias locales en la historia demográfica como la influencia africana mayor en algunas poblaciónes de Córdoba, entre otros eventos socioculturales recientes.
- PublicaciónAcceso abiertoColonización y sucesión de la comunidad fitoperifítica en el humedal el Silencio, San Sebastián de Mariquita, Colombia(Ibagué : Universidad del Tolima, 2018, 2018) Gordillo-Guerra, Jonathan GerardoEl proceso de sucesión ha sido un tema central en ecologia tanto en el enfoque clásico como contemporáneo. Tiene una gran relevancia en ecosistemas dulceacuícolas, particularmente en los lenticos, donde es posible determinar eventos de colonización, forma de crecimiento y abundancias relativas de las comunidades biológicas, en especial del fitoperifíton. El objetivo central del estudio fue evaluar la colonización y sucesión de la comunidad fitoperifítica durante un ciclo hidrológico en un humedal somero de zonas bajas (343 m.s.n.m.) del departamento del Tolima (Colombia). El estudio se desarrolló durante el periodo de altas lluvias, dos transiciones a bajas lluvias, bajas lluvias y transición a altas lluvias, con intervalos regulares de ocho (8) días consecutivos para el análisis de la colonización y sucesión perifítica en cada periodo climático. Se utilizó como sustrato artificial, láminas portaobjetos ancladas a soportes artificiales flotantes a diferentes profundidades (25, 50 y 75 cm) y se incluyeron algunas variables fisicoquímicas. En cada periodo evaluado, cada dos (2) días y durante ocho días consecutivos, los portaobjetos se colectaron directamente en bolsas plásticas resellables. Se registraron 71 especies, 25 géneros, 18 familias, 12 órdenes y 6 clases en 1702 muestras. La clase Euglenophyceae registró la mayor densidad con 1,1 x 107 células/cm2 (53,93%), seguido por Cryptophyceae con 5,5 x 106 células/cm2 (25,53%) y Bacillariophyceae con 3,8 x 106 células/cm2 (17,99%). A 25 cm de profundidad se presentó el valor más alto de densidad con 1,1 x 107 células/cm2 , mientras que a 75 cm se evidenció la menor densidad con 3,3 x 106 células/cm2 . Así mismo, a 25 cm se observó un aumento en la densidad de las especies más representativas, con un comportamiento inverso a mayor profundidad. El análisis del tiempo de colonización temporal (época climática) y diaria, evidenció un incremento de la densidad de la comunidad en la fase intermedia del estudio (4to y 6to día). El RDA mostró que el pH (p=0,047), alcalinidad (p=0,001) y oxígeno disuelto (p=0,008) influyeron significativamente en la distribución de la comunidad fitoperifitica durante los muestreos. Sin embargo, se encontró que las variables fisicoquímicas evaluadas no mostraron un efecto significativo en la composición de la comunidad fitoperifitica durante los días de colonización (p > 0,763). En conclusión, el efecto de la profundidad y el tiempo de colonización a nivel temporal y diario están ejerciendo una influencia significativa sobre la densidad y la diversidad de la comunidad fitoperifítica en los sustratos artificiales, en el humedal evaluado. Esta información es relevante para el manejo integral del humedal considerado, ya que la duración de las fases sucesionales y la dinámica de los taxones durante la colonización fitoperifítica, están determinadas por la variabilidad climática (factores exógenos) y por la respuesta de cada uno de éstos (factores endógenos), que deben influir sobre la productividad y el flujo de nutrientes en este humedal tropical somero. Palabras clave: Microalgas bentónicas, sustratos artificiales, tiempo de colonización, profundidad.
- PublicaciónRestringidoComparación de la calidad embrionaria resultante de dos técnicas empleadas en reproducción asistida(Ibagué: Universidad del Tolima, 2011., 2011) Navarro Carbonell, Doris Elena; Lucena Quevedo, Elkin (Asesor); Pulido Torres, Carlos Enrique (Director); Francis Turner, Liliana (Codirector)Muchos de los estudios realizados actualmente tratan de acercar las técnicas de Fertilización In Vitro (FIV) a las condiciones fisiológicas (in vivo) que se presentan en las primeras fases del desarrollo embrionario, es así como surge la técnica INVO (Intravaginal Culture Oocite) que utiliza la cavidad vaginal de la mujer y sus condiciones fisiológicas (Temperatura, oxígeno y CO2) para equilibrar el medio de cultivo y llevar a cabo la fertilización e incubación inicial del embrión. En este estudio se realizó una comparación de la calidad embrionaria obtenida mediante dos técnicas de fertilización in vitro. El esquema de estimulo que se utilizo en todas las pacientes fue MILD con CC (50-100 mg/día) y FSH (75-150 mg/día), cuando se observaron ecográficamente folículos de 14-16 mm, se empleo Baydol® (Acetamicina) 60 mg con el fin de evitar la ovulación espontánea de la paciente, 10.000UI de hCG fueron aplicadas cuando se tenían folículos de 17-18 mm y a las 36 horas pot hCG se realizó la aspiración folicular. En el laboratorio se procedió a la recuperación de los ovocitos y a su clasificación de acuerdo al complejo cumulus corona ovocito (Inseminación) o por la presencia del primer cuerpo polar (MII) (ICSI). El método de capacitación espermática empleado para el estudio fue el Swim up y el medio de cultivo embrionario fue G2 Plus versión 5 de vitrolife hasta las 72 h, ya fuera en incubadora con O2 20%, CO2 6% y un rango de temperatura de 37°C o un dispositivo (INVOCell) el cual, fue colocado en la cavidad vaginal de la paciente donde la vagina dio las condiciones de temperatura CO2 y O2 necesarias para el cultivo del embrión. Al cabo de los tres días de cultivo los embriones se clasificaron morfológicamente teniendo en cuenta el número y forma de las blastómeras, junto con el grado de fragmentación presentado. Un total de 137 casos fueron realizados en el estudio para 132 transferencias y con 43 pruebas de embarazo positivas a los 12 días postransferencia; la calidad embrionaria fue analizada mediante MANOVA dando diferencias significativas p = 0,0388 entre las dos técnicas de cultivo siendo de mejor calidad los embriones obtenidos mediante el INVO. En cuanto a los porcentajes de implantación (19.14 y 26.68% INVO vs 5 y 12.94% Incubadora), embarazo (30.95% y 48.88% INVO vs 11.11 y 24.32% Incubadora) y aborto (11.11 y 33% INVO vs 100% y 27.27% Incubadora) también se demostró una clara diferencia en los grupos INVO e incubadora siendo mejor en estos aspectos los embriones INVO. La técnica INVO es una buena opción para el tratamiento de parejas con problemas de infertilidad ya que genera embriones de buena calidad desde el punto de vista morfológico, capacidad de implantación, embarazo y bajas tasas de aborto. Se evidenció una clara superioridad en todos los parámetros evaluados donde los grupos INVO sobresalieron dentro del estudio siendo el mejor grupo INVO/ICSI, lo que hace pensar que esta técnica reduce los efectos adversos causados por el ROS generado en las incubadoras y cuando se realiza el ICSI.
- PublicaciónAcceso abiertoComposición florística, estructural y diversidad de los bosques de la Reserva Forestal Galilea, Tolima(Ibagué : Universidad del Tolima, 2008, 2008) Malagón Rodríguez, Wilson MarioSe caracterizó la composición florística y la estructura espacial de los bosques lluviosos sub-montanos localizados en la Reserva Forestal Galilea, municipio de Villarrica-Tolima, Colombia, en seis parcelas permanentes de 0.1 ha en bosques primarios. El área total fue 0.6 has, documentada gráficamente con detalles dibujados de perfiles. Esta reserva tiene aproximadamente 16000 has y está localizada en el flanco occidental de la cordillera oriental entre 1300 y 3100 m de altitud. En cada parcela se muestreó 0.1 ha, (10X100 m) y se censaron todos los individuos con DAP≥ 1 cm. Los bosques son estructuralmente homogéneos y están caracterizados por la abundancia de palmas arborescentes (incluyendo helechos) en los coluvios. La riqueza de magnoliophytos del área está representada por 108 familias de plantas vasculares, 317 géneros y unas 594 especies. Se inventarió un total de 6108 individuos de plantas leñosas con DAP ≥1 cm. En promedio 148 individuos arbustivos o arbóreos /0.1 ha con DAP≥ 5 cm, 74 árboles con un DAP≥ 10 cm. La altura media de la masa forestal es de 28 m, su altura dominante es de 35 m, aunque fuera de la parcela alcanza los 40 m. Las familias con mayor presencia de especies en las parcelas Melastomatáceas, Rubiáceas, Euphorbiáceas y Lauráceas. Se observó una clara diferenciación en tres estratos arbóreos, no solo por su composición específica, sino también por el peso relativo de ciertas familias. La distribución de las clases de frecuencias de los parámetros de altura, cobertura y DAP mostró que la mayoría de los individuos se agrupan en las clases inferiores y están albergados en el estrato arbóreo inferior. Las especies con mayor I.V.I. en promedio son: Quercus humboldtii (Fagaceae) 49%, Hyeronima macrocarpa (Euphorbiaceae) 43%; Aniba perutilis y Ocotea longifolia (Lauraceae) 40%, Protium cranipyrenum (Burseraceae) y Ficus maxima (Moraceae) con 35%. La riqueza de especies muestra que hay una correlación negativa con la altitud y este patrón se expresa entre la fertilidad del suelo y la densidad de los árboles. Mediante un análisis de componentes principales se identificaron dos tipos estructurales de bosques mostrando una clara relación con la variabilidad fisiográfica en el área. Los bosques sobre terrenos con inclinación media presentan una mayor heterogeneidad florística; en contraste los terrenos más escarpados y de suelos menos húmedos presentan una tendencia a la dominancia de Lauráceas como A. perutilis, “comino crespo”. De acuerdo al análisis de coordenadas polares tres parcelas presentaron alta similaridad florística, en cambio las áreas de piedemonte presentaron una leve tendencia a la disimilitud florística. Se concluye que los bosques de Galilea son tan ricos en especies como otros registrados en Colombia, Ecuador y Perú. La estructura y los valores de riqueza de plantas leñosas de los bosques de Galilea se acercan más al patrón expresado por los bosques con similaridades ambientales como los alto-andinos (montano). Los resultados de este estudio apoyan la idea de que la especialización edáfica de las especies arbóreas es muy baja. A partir de estos datos se espera adelantar estudios de captura de CO2 y un manejo silvicultural sostenible. Palabras claves: Andes, bosques montanos, Colombia, diversidad florística, Galilea, Índice de Shannon e Índice de valor e importancia, reserva forestal, Tolima, vegetación.
- PublicaciónAcceso abiertoComposición y estructura de la comunidad de mariposas diurnas en fragmentos de bosque seco tropical en el norte del departamento del Tolima Colombia.(Ibagué : Universidad del Tolima, 2016, 2016) Peña-Cerpa, Jaider ManuelUno de los ecosistemas que conforman los Andes colombianos es el bosque seco tropical (BST), originalmente cubría 9 millones de ha, de las cuales quedan alrededor de un 8%. La disminución de estas áreas boscosas se debe en parte a las presiones antropogénicas con fines de explotación y expansión de las fronteras agrícolas y ganaderas, transformando de manera importante el paisaje, generando la fragmentación del hábitat y perdida su diversidad. Esta situación motivo la realización del presente estudio encaminado a evaluar la composición y estructura de la comunidad de mariposas diurnas (Papilionoidea y Hesperioidea) en tres fragmentos de bosque seco tropical en el norte del departamento del Tolima. Se realizaron cuatro faenas de captura entre febrero a noviembre de 2015. Se utilizaron dos redes entomológicas con un esfuerzo de 30 horas/red/muestreo y 12 trampas Van Someren-Rydon cebadas con banano, pescado y heces humanas. Se colectaron 1589 adultos que corresponden a 160 especies. Nymphalidae fue la familia más abundante y diversa, destacándose Hamadryas februa ferentina por ser la especie más abundante. Se observa una variación en la abundancia y diversidad de las especies con un incremento con la complejidad estructural de los bosques, siendo Armero el más diverso y rico en individuos debido a la mayor heterogeneidad estructural y complejidad paisajística. Los análisis de similitud y ordenamiento demostraron que existen diferencias en las comunidades que conforma cada una de las localidades. La abundancia y diversidad se incrementa en febrero y mayo con el aumento de la precipitación. La estructura de cada uno de los bosques pueden explicar en parte las diferencias en composición, diversidad y abundancia de mariposas en el bosque seco.
- PublicaciónAcceso abiertoComposición y estructura de la comunidad de peces y sus relaciones con la calidad de la vegetación riparia y algunas variables ambientales en dos ríos de bosque seco tropical, Tolima Colombia(Ibagué : Universidad del Tolima, 2013, 2013-08) López Delgado, Edwin OrlandoEste trabajo se desarrolló en el departamento del Tolima en cuatro zonas de estudio, dos en el Río Venadillo y dos en el Río Opia, cuyas cuencas se localizan entre los 250-600 m. en la zona de vida de Bosque seco Tropical (Bs-T) de acuerdo al sistema de clasificación de Holdridge. Se evaluaron los ensamblajes de la comunidad de peces durante un ciclo hidrológico (2011-2012) con el objetivo principal de determinar la influencia de algunas variables ambientales (calidad de la vegetación riparia, precipitación y algunos parámetros físicos y químicos de los cuerpos de agua) sobre la dinámica de los ensamblajes de peces. En cada uno de los cuerpos de agua se establecieron dos tramos entre los 250 y 600 m. donde se realizaron muestreos bimensuales empleando los métodos de electropesca y redes de arrastre para la colecta de los organismos. En cada una de las estaciones se desarrolló un muestreo aleatorio estratificado en los hábitats rápidos y remansos teniendo en cuenta los sustratos presentes en cada uno; paralelo a la colecta biológica; se tomaron muestras de agua para el análisis de 15 variables fisicoquímicas, y también se determinó el índice de calidad del bosque de ribera (QBR). Durante los seis muestreos realizados se registró un total de 3533 individuos, agrupados en seis órdenes, 19 familias y 47 especies, las cuales representan aproximadamente el 33% de las especies reportadas para el Alto Magdalena. Los Characiformes y Siluriformes fueron los órdenes con los valores más altos de abundancia, representando aproximadamente el 96% del total de los organismos colectados. Las familias Characidae, Loricariidae y Trichomycteridae corresponden a cerca del 83% de los organismos colectados; en cuanto a las especies las más abundantes y frecuentes durante todo el estudio fueron Creagrutus affinis (15.07%), Trichomycterus banneaui (14.90%), Chaetostoma aff. fischeri (11.47%) y Astyanax fasciatus (10.25%). Con relación a los hábitats evaluados, se registró un ensamblaje propio en cada uno de ellos; hecho que se deben posiblemente a la ecomorfología de cada una de las especies. Gracias a los datos y análisis realizados durante este estudio se evidenció que que los principales factores que determinan la composición, estructura y abundancia de la fauna íctica fueron: calidad de la vegetación riparia (QBR), conductividad eléctrica (CE), Sólidos suspendidos (SS), Temperatura del agua (T agua) y el régimen hidrológico regional (precipitación). Con relación a este último se observó que durante el primer pico de altas precipitaciones el número de especies y el índice de diversidad de Shannon se relacionaron de forma inversa con la precipitación, es decir en las épocas de mayor precipitación los valores de estos índices fueron bajos, y en las épocas de baja precipitación altos, hecho que se debe posiblemente a la oferta alimenticia de organismos como macroinvertebrados acuáticos y perifiton, cuya colonización y dinámica espacio-temporal pueden verse afectadas por la variabilidad y estabilidad de los sustratos. Según el análisis de correspondencia Canónica, uno de los factores de mayor peso y que influye de manera significativa sobre los ensamblajes de peces fue la calidad de la vegetación riparia; ya que en algunas zonas donde se presenta un Inicio de alteración importante y calidad intermedia, se puede evidenciar una afectación negativa en el número de taxones, número de categorías tróficas y variación en los valores del índice de diversidad de Shannon, así como también un aumento en los valores del índice de dominancia.
- PublicaciónRestringidoComposición y estructura de Tricópteros en cuencas con bosque seco tropical del departamento del Tolima(Ibagué : Universidad del Tolima, 2012, 2012) Vásquez Ramos, Jesús Manuel
- PublicaciónRestringidoDiferenciación molecular de poblaciones de heteromys anomalus y heteromys australis de colombia utilizando la variación en secuencias del adn mitocondrial(Ibagué: Universidad del Tolima, 2011., 2011) Yara Ortíz, Derly Constanza; García Pinzón, Luis Fernando (Director); Villa, Francisco Antonio (Codirector)La familia Heteromyidae incluye cinco géneros, de los cuales únicamente Heteromys se encuentra en Colombia y comprende: H. anomalus, H. australis y H. desmarestianus, para las cuales su distribución es incierta en gran parte del territorio Colombiano. Adicionalmente, los caracteres morfológicos que definen las especies, presentan variación asociada a la edad lo que dificulta su correcta identificación. Utilizando la variación en las secuencias de los genes Citocromo-b (801 pb) y Citocromo Oxidasa I (670 pb) se estudió la variabilidad genética y las relaciones filogenéticas en Heteromys de Colombia. Un total de 25 secuencias del gen Cit-b y 20 del gen COI fueron obtenidas para los análisis genéticos y reconstrucción filogenética mediante máxima parsimonia, máxima verosimilitud e inferencia bayesiana. No se detectaron inserciones, deleciones o codones de parada sugiriendo que los datos no corresponden a copias nucleares. Valores de variación interespecífica oscilaron en un rango de 11 a 19% para Cit-b y de 10 a 14% para COI. Los análisis filogenéticos mostraron tres clados bien soportados con bootstrap y probabilidades a posteriori para las tres especies colombianas; un cuarto clado que corresponde a individuos de H. australis localidad Amalfi mostró valores de variación interespecífica entre 11 y 19% para Cit-b y 10 a 14% para COI, similares a comparaciones entre las otras especies. El mapeo de sustituciones en la filogenia resultante muestra mutaciones específicas para los diferentes clados que resultan en cambios sinónimos. Se sugiere la existencia de una nueva especie del género Heteromys en Colombia y la necesidad de estudios morfométricos, morfológicos y moleculares complementarios para su validez científica.
- PublicaciónAcceso abiertoDinámica de la abundancia relativa e infección natural de Lutzomyia longiflocosa en un foco epidémico de Leishmania en Chaparral, Tolima(Ibagué : Universidad del Tolima, 2008, 2010) Marin Casas, Dairo HumbertoIntroducción: Durante los años 2003-2004, en el municipio de Chaparral (Tolima) se presento un alto porcentaje de niños (36,5% de 2.835 casos entre 0-15 años) y mujeres (35,5% de 1.811 adultos) afectados durante la mayor epidemia de leishmaniasis cutánea (LC) reportada en Colombia. Esto permitió plantear que la transmisión fue de tipo doméstica o peridoméstica. Objetivo: Determinar la composición y abundancia estacional de especies de Lutzomyia y prevalencia de infección natural de L. longiflocosa con Leishmania (Viannia) en el intradomicilio, peridomicilio y bosque en dos veredas, una con alta y otra con baja prevalencia de la enfermedad en el foco epidémico de (LC) en Chaparral-Tolima. Materiales y métodos: Para el estudio se identificaron dos veredas, una con alta prevalencia de infección (Agua bonita 74% de 172 habitantes) y otra con baja (Irco dos Aguas 1,3% de 354 habitantes). Tres casas de cada una de las veredas, previamente seleccionadas, fueron muestreadas mensualmente, colocando trampas de luz CDC en intradomicilio (1), peridomicilio (2) y bosque (2). Las poblaciones de Lutzomyia fueron muestreadas mensualmente durante un año para determinar las abundancias poblacionales relativas entre periodos de alta y baja precipitación. La prevalencia de infección natural en L. longiflocosa capturadas en las dos veredas, se realizo en grupos de insectos (120) organizados por casa/mes/hábitat a través de la técnica PCR-Southern-Blot utilizando como blanco el kDNA de Leishmania (Viannia). Resultados: Se encontraron diferencias significativas en el total de capturas y composición de especies de Lutzomyia entre las dos veredas. En Agua Bonita se capturó el 99,3% de los especímenes. En esta vereda, cinco especies fueron predominantes: Lutzomyia longiflocosa (83,1% de 9.929), L. columbiana (7,5%), L. (Helcocyrtomyia) spp (4,7%), L. trinidadensis (2,6%), y L. nuneztovari (2%). L. longiflocosa fue la especie más abundante en todos los ambientes y meses evaluados. Esta especie presentó su mayor densidad poblacional durante los meses de baja precipitación en agosto-septiembre de 2007 y febrero 2008. En la vereda Irco Dos Aguas, las especies de Lutzomyia presentaron bajas densidades poblacionales durante todo el estudio. En esta vereda no se detectaron infecciones naturales por Leishmania (Viannia) en Lutzomyia longiflocosa. En el presente estudio. Las infecciones naturales se encontraron únicamente en la vereda Agua Bonita, La más alta prevalencia de infección fue registrada en intradomicilio (1,4% - 2,4%) y peridomicilio (1,5% - 3,71%) que en bosque (0,14% - 0,18%). Las infecciones naturales fueron detectadas principalmente en los meses con mayor densidad poblacional. Conclusiones: Las diferencias significativas en abundancia poblacional de flebótomos encontradas entre las dos veredas durante el periodo de tiempo evaluado explican en parte las diferencias de transmisión de LC presentadas en estas veredas durante la epidemia. La mayor abundancia poblacional de L. longiflocosa durante los periodos de baja precipitación, junto a sus altas tasas de infección con Leishmania (Viannia) en el intradomicilio y peridomicilio durante estos periodos en la vereda de alta prevalencia de LC, sugiere que esta especie está directamente relacionada con la transmisión domestica de Leishmania. Permanece desconocido el posible papel vectorial de las otras especies de Lutzomyia en la región, posiblemente pueden jugar un papel secundario en la transmisión. Los patrones de abundancia poblacional de Lutzomyia y la infección natural de L. longiflocosa durante los meses de menor precipitación sugieren que en estos meses se deben priorizar las acciones de control para prevenir la transmisión.
- PublicaciónRestringidoDiversidad filogenética(Ibagué: Universidad del Tolima, 2008., 2008) Urrea Montes, Daniel Alfonso; Vallejo, Gustavo Adolfo (Director)Con el objetivo de evaluar la diversidad filogenética de los linajes KP1 (+) y KP1 (-) de T. rangeli, se realizó un análisis de RAPD y se secuenciaron directamente los productos de amplificación de la región intergénica del gen mini-exón para su análisis filogenético. Los resultados del análisis de secuencias confirman los obtenidos por análisis de RAPD, encontrándose una clara divergencia filogenética entre las cepas de T. rangeli pertenecientes a los linajes KP1 (+) y KP1 (-) e indicando la presencia de al menos 4 subgrupos de cepas, genéticamente diferentes y asociados a vectores derivados de diferentes líneas evolutivas del género Rhodnius, un grupo KP1 (+) asociado al grupo “prolixus” y tres grupos de cepas KP1 (-) asociados a los vectores R. pallescens, R. colombiensis y R. ecuadoriensis pertenecientes al grupo “pallescens”. La alta homología dentro cada subgrupo contrasta con la alta variabilidad encontrada entre los mismo, soportando la posible existencia de una estructura genética de predominancia clonal. Los resultados también sugieren que las cepas denominadas T. rangeli-like, corresponden a cepas de T. rangeli con problemas de identificación taxonómica, debido al poco conocimiento de las interacciones biológicas entre estas cepas y sus vectores específicos. Este trabajo muestra que el estudio de la coevolución entre los diferentes linajes de T. rangeli y las diferentes líneas evolutivas del género Rhodnius, tienen implicaciones taxonómicas y epidemiológicas, las cuales ayudan a entender el papel de los diferentes genotipos de T. rangeli que circulan en los diferente vectores en Suramérica y su papel en la epidemiologia de la enfermedad de Chagas.
- PublicaciónRestringidoEfecto de la infección con leishmania panamensis(Ibagué: Universidad del Tolima, 2011., 2011) Arévalo Cortés, Andrea Cisney; Valderrama, Liliana (Directora); Vallejo, Gustavo Adolfo (Codirector)que les permite sobrevivir, replicarse y protegerse del ataque directo del sistema inmunitario. Otros en cambio, pueden inducirla para garantizar la fagocitosis por parte de otra célula hospedera y perpetuar la infección. Con el fin de establecer si diferentes subgéneros de especies de Leishmania usan la apoptosis para promover la persistencia de la infección, se evaluó el efecto de la infección con L. panamensis, L. mexicana y L. donovani en la apoptosis de macrófagos humanos de la línea U937. En el presente trabajo, L. donovani se utilizó como control, ya que esta especie inhibe la apoptosis de la célula hospedera. Hasta el momento no se conoce si las especies de Leishmania del subgénero Viannia inducen o inhiben la apoptosis de las células hospederas, razón que fundamenta el trabajo que se ha planteado en el presente estudio. Para este trabajo se infectaron macrófagos humanos U937 con L. panamensis, L. mexicana y L. donovani. Los macrófagos infectados y no infectados se trataron con inductores de apoptosis: estaurosporina, camptothecina y D-PBS, durante 8, 24, 48 y 72 horas. Mediante citometría de flujo, se evaluó la exteriorización de fosfatidilserina con Annexin V-PE y 7AAD y la fragmentación de ADN con el ensayo de TUNEL. Además, se determinó la viabilidad de amastigotes en células apoptóticas mediante tinción con Syto 16 (viabilidad) y Annexin V-Alexa 568 (apoptosis), mediante microscopía de fluorescencia. En este trabajo se observó que la infección con L panamensis indujo exteriorización de fosfatidilserina en el macrófago. Ésta no modificó los niveles de dicho fosfolípido del macrófago frente a un estímulo de apoptosis como estaurosporina, camptothecina y D-PBS. Además, esta especie no inhibió, ni indujo la fragmentación del ADN de la célula hospedera. L. mexicana, por su parte, no produjo efecto en la externalización de la fosfatidilserina del macrófago, pero inhibió de forma significativa la fragmentación del ADN en el mismo. La infección con L. donovani inhibió la externalización de la fosfatidilserina y la fragmentación del ADN de la célula fagocítica. Aunque L. panamensis y L. mexicana fueron más infectivas que L. donovani no fue posible correlacionar la infectividad con el efecto que causan las especies sobre la apoptosis del macrófago. Estos resultados serán importantes para considerar que el fenómeno de persistencia en la leishmaniasis puede estar relacionado a un evento de inducción de la externalización de fosfatidilserina, ya que es una señal de “silenciamiento” del mecanismo efector del macrófago. Además, en el presente trabajo se comprobó que en las células apoptóticas sobrevivieron los amastigotes de las tres especies de Leishmania evaluadas y se observaron parásitos vivos dentro de cuerpos apoptóticos que pueden ser la forma para pasar desapercibidos por el sistema inmune y lograr perpetuar la infección en su hospedero definitivo, el macrófago.