Examinando por Materia "cáncer"
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- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis genético del cáncer colorrectal en poblaciones mestizas de Colombia(Sello Editorial Universidad del Tolima, 2019) Criollo Rayo, Ángel Alexandro; Echeverry, María Magdalena; Carvajal Carmona, Luis GuillermoEl texto, tesis doctoral de uno de los autores, Ángel Alexandro Criollo, recopila parte de los resultados del proyecto de investigación «Genetic Study of Common Bowel Cancer in Hispania and the Americas –CHIBCHA-», obtenidos a partir del estudio de la muestra colombiana, constituida por más de 1.000 casos y sus respectivos controles, captados principalmente en la región andina colombiana y genotipificados para ~1,3 millones de marcadores. CHIBCHA es uno de los proyectos en cáncer de colon y recto más importantes de la región latinoamericana, auspiciado por la Unión Europea en 7 países - 4 latinos y 3 europeos-, coordinado por la Universidad de Oxford y liderado en Latinoamérica por el grupo de Citogenética, Filogenia y Evolución de Poblaciones - Categoria A1 COLCIENCIAS – 2017-, del cual hacen parte los autores. La tesis se desarrolló en el marco del programa de investigación: Análisis genético poblacional de enfermedades humanas, que tiene como eje fundamental la genética básica de distintos tipos de cáncer y el mapeo genético de poblaciones indígenas colombianas. Los hallazgos que se reportan en el libro incluyen el impacto de distintos aspectos genéticos y su relación con la susceptibilidad al carcinoma colorrectal -CCR- en un contexto ancestral de mezcla genética. Las aproximaciones metodológicas y de análisis, involucraron múltiples regiones cromosómicas abordadas en otras partes del mundo, de las cuales se conoce poco en poblaciones latinoamericanas. Se consideraron aspectos como el impacto de la estructura genética poblacional y los grados de ancestría genética en relación con la susceptibilidad al CCR, además de la homocigosidad y la epistasis, para describir las interacciones SNP-SNP. Los resultados, obtenidos y analizados por metodologías bioinformáticas, aportan conocimiento nuevo acerca de la organización genómica y la diversidad de la población colombiana.
- PublicaciónAcceso abiertoAnálisis genético del cáncer colorrectal en poblaciones mestizas de Colombia(Ibagué : Universidad del Tolima, 2017, 2017) Criollo Rayo, Ángel AlexandroLa mayoría de los marcadores de susceptibilidad al carcinoma colorrectal (CCR) se han identificado inicialmente en poblaciones europeas, utilizando técnicas como las de estudios amplios de asociación del genoma (GWAS) y el mapeo fino por ligamiento. Estos marcadores, no necesariamente tienen un impacto en el fenotipo; pueden estar señalando un gen candidato, verdadera causal de la asociación. En este trabajo, se analizan, en relación con el riesgo a CCR, las regiones cromosómicas comprometidas y el rol del mestizaje; para lo cual se integran datos genéticos, análisis estadísticos y ensayos bioinformáticos de 20 regiones cromosómicas, en los 955 casos y 968 controles provenientes del proyecto «Genetic Study of Common Bowel Cancer in Hispania and the Americas –CHIBCHA-», en la Región Andina Colombiana. Se utilizaron dos paneles de Affymetrix, para tipificar 1.169.944 SNPs y evaluarlos, teniendo en cuenta el desequilibrio de ligamiento, las historias demográficas, el mestizaje, la estructura genética, la ancestría local y patrones de interacciones SNP-SNP. Cinco regiones se asociaciaron significativamente al riesgo (18q21.1, 19q13.11, 10p14, 14q22.2, 8q23.3); por mapeo fino se descartó la 14q22.2, pero se anexaron otras dos (20p21.3 y 8q24.21) que presentaron picos significativos; en marcadores no reportados, con una estructura haplotípica particular. El componente ancestral europeo, se asoció con el riesgo; a nivel cromosómico local, se detectaron las regiones 6q23.2 y 4p13; se evidenció el efecto del mestizaje con nuevas relaciones alélicas y se observaron bloques genéticos distintos a los de las poblaciones europeas. Las regiones asociadas revelan un transfondo molecular común del desarrollo y patogénesis del CCR en humanos, vías de señalización celular previamente identificadas en europeos y asiáticos, importantes para la homeóstasis del crecimiento, la diferenciación y la migración celular. Los resultados, que amplìan el conocimiento de la patogénesis molecular y su potencial aplicación en el campo del diagnóstico y tratamiento, están siendo sometidos a validación con otras cohortes. Palabras clave: Cáncer, colorrecto, Colombia, Mezcla genética, riesgo, SNPs
- PublicaciónRestringidoAnálisis genético molecular en tumores colorrectales de pacientes tolimenses(Ibagué : Universidad del Tolima, 2009, 2009) Flórez Delgado, Nancy Yaneth
- PublicaciónAcceso abiertoGenética del carcinoma colorrectal con agregación familiar, en una muestra de la Región Andina colombiana(Ibagué : Sello Editorial Universidad del Tolima, 2019., 2019) Bohórquez Lozano, Mabel Elena; Estrada Flórez, Ana Patricia; Vélez Bohórquez, Anggi Margarita; Echeverry de Polanco, MagdalenaEste libro sobre el cáncer colorrectal (CCR), con agregación familiar, constituye un aporte para quienes se inician en la actividad médica, la genética, la investigación y la salud pública y también para aquellos que se encuentran en una etapa más avanzada de la misma, quienes muy seguramente después de leerlo, desearan continuar en el ejercicio de la investigación.
- PublicaciónRestringidoIdentificación molecular del Virus Papiloma Humano y virus respiratorios en muestras respiratorias en niños menores de 5 años en Bogotá Colombia(Ibagué : Universidad del Tolima, 2013, 2013) Lozano Mosos, Juan SebastiánEl impacto de los estudios sobre la detección del virus de papiloma humano en el cáncer de pulmón (Syrajanën, 2012), han acelerado el interés de comprender el papel etiológico del VPH en el carcinoma bronquial, así como la desconocida asociación entre la infección por VPH con los virus respiratorios causantes de la infección respiratoria aguda y las variables clínicas. En este estudio observacional retrospectivo de corte transversal, de identificó molecularmente la infección del VPH en (28/219) aspirados nasofaríngeos tomados a niños menores de 5 años que tenían infección respiratoria aguda y que cumplieron con la definición de caso establecida para los periodos de enero a diciembre del 2010 y 2011. En todas las muestras a través de la inmunofluorescencia indirecta (IFI), se realizó la detección de los 7 virus respiratorios de notificación obligatoria y sobre las muestras con resultado positivo pata el BPH genérico, se realizó la PCR múltiplex en tiempo real desarrollada in house, para la detección de los 7 virus de notificación obligatoria y los virus nuevos descritos como agentes casuales de la IRA. Se encontró que el 12,78% (28/219) de las muestras analizadas fue positivo para cualquier tipo de VPH mediante la PCR convencional, posteriormente a estas muestras se les realizó la detección tipo especifica para los tipos VPH 6/11, - 16, -18 y de estas el 50% (14/28) fue positivo para VPH 6/11, el restante 50% correspondió a otros tipos de VPH que no fueron identificados en nuestro estudio. Mediante la técnica del IFI se encontró el 56,16% (123/219) de positividad para alguno de los virus de notificación obligatoria de circulación en el distrito. A través de la PCR múltiplex en tiempo real se halló con mayor frecuencia el virus sincitial respiratorio B con el 14,29% (4/28) seguido por el adenovirus con el 10,71% (3/28). Se presentaron coinfecciones con el 7,14% (2/28) para el virus sincitial respiratorio y el adenovirus y con un 3,57% (1/28) que involucraron los virus sincitial respiratorio A + adenovirus + parainfluenza 3. El 53,57% (15/28) de las muestras analizadas no presentó ningún virus respiratorio. Las pruebas de Ji cuadrado y odds ratio ajustados por el método de Mantel y Haenszel permitieron observar la relación presentada entre la detección de la infección por VPH con la variable clínica de infiltrados neumónicos con un OR (4,32) y Ji cuadrado de 10,914 así como también con el adenovirus con un OR (2,87) y Ji cuadrado de 6, 092, evidenciándose la asociación de las mismas con el riesgo de contraer la infección por VPH. Los resultados permitieron establecer la prevalencia del VPH en el tracto respiratorio de niños y niñas menores de 5 años, adicionalmente se encontró la asociación con variables clínicas como la presencia de infiltrados neumónicos y los virus respiratorios presentes en dichas muestras. De esta manera se plantea desarrollar estudios prospectivos que permitan evaluar la dinámica de la infección por VPH en los niños y su asociación con los virus respiratorios.
- PublicaciónAcceso abiertoPerfil molecular y epidemiología del carcinoma colorrectal esporádico en Colombia(Ibagué : Sello Editorial Universidad del Tolima, 2019., 2019) Bohórquez Lozano, Mabel Elena; Criollo Rayo, Ángel Alexandro; Vélez Bohórquez, Anggi Margarita; Carvajal Carmona, Luis GuillermoEn el trabajo se plasma la necesidad de establecer políticas públicas de tamizaje para el CCR, en la población menor de 50 años, con el fin de identificar pacientes en riesgo, a los cuales se les pueda ofrecer estrategias preventivas, tratamiento personalizado, un diagnóstico más temprano del actual y prevención de los estados avanzados de la enfermedad. Con relación a este último punto, los autores plantean nuevos caminos para el estudio del CCR, por ejemplo, apoyar el desarrollo de los registros poblacionales de cáncer, que posibilitan estudios epidemiológicos para determinar los factores etiológicos que contribuyen a la incidencia del síndrome y la introducción en los planes de salud estatal, de un tamizaje con un panel molecular, para genes conocidos, relacionados con CCR esporádico, como herramienta para el desarrollo de nuevas estrategias diagnósticas y terapéuticas.