Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania

Benavides Cerquera,  Jennyfer Dahiana

Publicación:
Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania

dc.contributor.author	Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana	spa
dc.date.accessioned	2014-08-20T19:30:31Z
dc.date.available	2014-08-20T19:30:31Z
dc.date.issued	2013-08
dc.description	78 Páginas. Recurso Electrónico	spa
dc.description.abstract	El alineamiento múltiple del interactoma de las tres especies de Leishmania (L. major, L. braziliensis y L. infantum) permitió identificar proteínas ortólogas presentes en los proteomas de estas tres especies y 256 interacciones conservadas tanto en el alineamiento múltiple como en la red original de cada una de estas tres especies, donde la mayoría de las proteínas que integran estas interacciones conservadas son dineínas de cadena pesada, las cuales participan en procesos como en el movimiento basado en microtúbulos, motilidad ciliar o flagelar y ATP catabólico. Otras proteínas encontradas fueron las metalopeptidasas de zinc dependientes de ATP, las cuales no tienen homología con las del ser humano y son importantes para la supervivencia del amastigote, estadio en el cual se produce la leishmaniasis en el ser humano; razón por la cual se podrían proponer como posibles blancos terapéuticos. Y las proteínas de mantenimiento de minicromosomas (MCM), las cuales hacen parte del proceso biológico de replicación del ADN; sugiriendo a estas tres proteínas como el grupo principal para caracterizar y explorar como dianas terapéuticas.	spa
dc.description.abstract	ABSTRACT. Interactome Multiple alignment of the three species of Leishmania (L. major, L. braziliensis and L. infantum) identified orthologous proteins present in the proteome of these three species and 256 conserved interactions both multiple alignment as in the original network of each these three species, where most of the proteins that make these conserved interactions are dyneins heavy chain, which are involved in processes such as the microtubule-based movement, ciliary or flagellar motility and ATP catabolic. Other proteins were found ATP-dependent zinc metallopeptidase, which have no similarity to those of humans and are important for the survival of the amastigote, stage where leishmaniasis occurs in humans; reason could proposed as potential therapeutic targets. And minichromosome maintenance proteins (MCM), which are part of the biological process of DNA replication; suggesting these three proteins as the primary group to characterize and explore as therapeutic targets.	spa
dc.description.tableofcontents	INTRODUCCIÓN 16 1. DEFINICIÓN DEL PROBLEMA 19 2. JUSTIFICACIÓN 21 3. OBJETIVOS 23 3.1 OBJETIVO GENERAL 23 3.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS 23 4. DISEÑO METODOLÓGICO 24 4.1 INTERACTOMAS DE TRES ESPECIES DE Leishmania (L.major, L.infantum y L.braziliensis) 24 4.2 COMPARACIÓN DEL PROTEOMA DE LAS TRES ESPECIES DE Leishmania 24 4.3 ALINEAMIENTO DE LOS INTERACTOMAS DE LAS TRES ESPECIES DE Leishmania 25 4.3.1 Pinalog 25 4.3.2 Isorank 25 4.4 DETECCIÓN DE INTERACCIONES CONSERVADAS ENTRE LOS TRES INTERACTOMAS 26 4.5 ANÁLISIS FUNCIONAL DE REDES COMPARTIDAS 26 5. MARCO REFERENCIAL 28 5.1 LEISHMANIA.28 5.1.1 Ciclo de vida de Leishmania sp 29 5.1.2 Agente etiológico de la leishmaniasis 31 5.1.3 Vectores 33 5.1.4 Reservorios 34 5.1.5 Distribución geográfica 36 5.1.6 Manifestaciones clínicas 37 5.1.6.1 Leishmaniasis cutánea (LC) 38 5.1.6.2 Leishmaniasis mucosa (LM) 41 5.1.6.3 Leishmaniasis Visceral (LV) 42 5.2 REDES DE INTERACCIÓN DE PROTEÍNAS 44 5.2.1 Predicción computacional de interacciones proteína-proteína 46 5.2.2 Comparación de Redes de Interacción de proteínas 47 5.2.2.1 Modos de métodos comparativos de redes 49 5.3 ALGORITMOS UTILIZADOS EN LA COMPARACIÓN DE REDES DE INTERACCIÓN DE PROTEÍNAS DE TRES ESPECIES DE Leishmania 50 5.3.1 Pinalog 50 5.3.2 Isorank 53 5.4 CYTOSCAPE 54 6. RESULTADOS 55 6.1 DETECCIÓN DE INTERACCIONES CONSERVADAS EN LAS TRES ESPECIES DE Leishmania 55 6.2 ANÁLISIS FUNCIONAL DE REDES COMPARTIDA 58 7. DISCUSIÓN 62 8. CONCLUSIONES 66 9. RECOMENDACIONES 68 REFERENCIAS 69	spa
dc.format.mimetype	application/pdf	spa
dc.identifier.citation	Benavides Cerquera, Jennyfer Dahiana. Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmanía. 78 h. 2013. Ibagué : Universidad del Tolima, 2013. <http://repository.ut.edu.co/handle/001/1083>	spa
dc.identifier.local	T 0701 234 CD3221
dc.identifier.other	CD3221
dc.identifier.uri	https://repository.ut.edu.co/handle/001/1083
dc.language.iso	spa	spa
dc.publisher	Ibague : Universidad del Tolima, 2013.	spa
dc.rights	Atribución-NoComercial-CompartirIgual 2.5 Colombia (CCBY-NC-SA 2.5 CO)	spa
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess	spa
dc.rights.uri	http://www.creativecommons.org/licenses by-nc/2.5/co/	spa
dc.subject	Alineamiento	spa
dc.subject	Interactoma	spa
dc.subject	Leishmania	spa
dc.subject	Dineina	spa
dc.subject	MCM	spa
dc.subject	Metalopeptidasa	spa
dc.subject	Alignment	eng
dc.subject	Interactome	eng
dc.subject	Leishmania	eng
dc.subject	Dynein	eng
dc.subject	Metallopeptidase	eng
dc.thesis.discipline	Facultad de Ciencias, Programa de Biología	spa
dc.thesis.grantor	Muskus, Carlos Enrique (Director)	spa
dc.thesis.level	Pregrado	spa
dc.thesis.name	Biólogo	spa
dc.title	Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania	spa
dc.type	Trabajo de grado - Pregrado	spa
dc.type.dcmi-type-vocabulary	Text	spa
dc.type.driver	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis	spa
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/submittedVersion	spa
dspace.entity.type	Publication

Archivos

Bloque original

Mostrando1 - 2 de 2

Nombre:: RIUT-AAA-spa-2013-Análisis comparativo de tres redes de interacción de proteínas de Leishmania.pdf
Tamaño:: 1.91 MB
Formato:: Adobe Portable Document Format
Descripción:

Descargar