ANÁLISIS DE PREFERENCIAS ALIMENTICIAS, DIVERSIDAD BACTERIANA Y VIRAL EN POBLACIONES DE Aedes aegypti CIRCULANTES EN EL MUNICIPIO DE IBAGUÉ A TRAVÉS DE METATRANSCRIPTÓMICA

BRIÑEZ ZABALETA, WEIMAR DAVID

Publicación:
ANÁLISIS DE PREFERENCIAS ALIMENTICIAS, DIVERSIDAD BACTERIANA Y VIRAL EN POBLACIONES DE Aedes aegypti CIRCULANTES EN EL MUNICIPIO DE IBAGUÉ A TRAVÉS DE METATRANSCRIPTÓMICA

dc.contributor.advisor	URREA MONTES, DANIEL ALFONSO
dc.contributor.advisor	VALLEJO, GUSTAVO ADOLFO
dc.contributor.advisor	CARRANZA MARTINEZ, JULIO CESAR
dc.contributor.author	BRIÑEZ ZABALETA, WEIMAR DAVID
dc.date.accessioned	2024-05-02T14:22:59Z
dc.date.available	2024-05-02T14:22:59Z
dc.date.issued	2024
dc.description.abstract	Aedes aegypti, es considerado el principal vector de arbovirus de importancia en salud pública. El estudio e identificación del microbiota del vector (virus, bacterias, hongos y parásitos) es de gran importancia, pues sus interacciones pueden ser relevantes para comprender la capacidad vectorial y efectuar vigilancia y control de estas arbovirosis y otras enfermedades. Este trabajo muestra la identificación de fuentes alimenticias, bacterias y virus circulantes en poblaciones de A. aegypti de la ciudad de Ibagué a través de RNAseq. Se colectaron adultos de A. aegypti procedentes de cuatro comunas de la con alta incidencia para arbovirosis de importancia médica durante la época de pandemia. A partir de pools de 50 hembras/comuna, se realizó RNAseq a través del instrumento Novaseq 6000 con depleción de rRNA. Seguidamente, fueron depurados las lecturas para ser ensambladas de novo con Trinity versión 2.13 (Grabherr et al., 2011). La identificación de preferencias alimenticias, riqueza y abundancia de virus y bacterias se llevó a cabo empleando los programas Blastx y Blastn, Kraken2 y MEGAN6. Se identificaron los hospederos de alimentación para A. aegypti. Se determinaron las familias bacterianas para cada una de las localidades evaluadas y se realizó la comparación de diversidad entre estas. Se identificaron especies virales pertenecientes al vector, de las cuales algunas pueden tener implicaciones en la competencia vectorial como Phasi Charoen-like virus. A. aegypti es un vector altamente antropofílico, sin embargo, también puede alimentarse de pequeños mamíferos, aves y especies de importancia pecuaria. La diversidad bacteriana entre localidades varia en la composición de familias, adicionalmente esta variabilidad parece estar ligada a la alimentación. El viroma central en A. aegypti se encuentra conservado; la prevalencia de arbovirus de importancia en salud pública encontrada en este trabajo fue nula.	spa
dc.description.abstract	Aedes aegypti is considered the primary vector of arboviruses of public health significance. The study and identification of the vector's microbiota (viruses, bacteria, fungi, and parasites) are of great importance, as their interactions may be relevant for understanding vectorial capacity and for conducting surveillance and control of arboviroses and other diseases. This work presents the identification of food sources, bacteria, and circulating viruses in A. aegypti populations in the city of Ibagué through RNAseq. Adults of A. aegypti were collected from four districts with high incidence of medically important arboviruses during the pandemic period. RNAseq was performed on pools of 50 females/district using the Novaseq 6000 instrument with rRNA depletion. Subsequently, the reads were filtered and de novo assembled with Trinity version 2.13 (Grabherr et al., 2011). Identification of feeding preferences, richness, and abundance of viruses and bacteria was carried out using the Blastx and Blastn programs, Kraken2, and MEGAN6. Hosts for A. aegypti feeding were identified, and bacterial families for each evaluated location were determined, with a comparison of diversity between them. Viral species belonging to the vector were identified, some of which may have implications in vectorial competence, such as Phasi Charoen-like virus. A. aegypti is a highly anthropophilic vector; however, it can also feed on small mammals, birds, and species of veterinary importance. Bacterial diversity among locations varies in family composition, and this variability appears to be linked to feeding habits. The core virome in A. aegypti is conserved; the prevalence of arboviruses of public health importance found in this work was null. Keywords: Arthropod-specific viruses, endogenous bacteria, feeding preferences.	eng
dc.description.degreelevel	Pregrado
dc.description.degreename	Biologo
dc.format.extent	114 p.
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.uri	https://repository.ut.edu.co/handle/001/3826
dc.publisher	Universidad del Tolima
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias
dc.publisher.place	IBAGUÉ-TOLIMA
dc.publisher.program	Biología
dc.rights	Todos los derechos reservados. Queda prohibida la reproducción total o parcial de este libro por cualquier medio, sin autorización expresa del titular del derecho de autor.
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar	http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.license	Atribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.subject.ddc	570 - Biología
dc.subject.lem	Microbiología
dc.subject.proposal	Virus específicos de artrópodos
dc.subject.proposal	Bacterias endógenas
dc.subject.proposal	Preferencias alimenticias.
dc.title	ANÁLISIS DE PREFERENCIAS ALIMENTICIAS, DIVERSIDAD BACTERIANA Y VIRAL EN POBLACIONES DE Aedes aegypti CIRCULANTES EN EL MUNICIPIO DE IBAGUÉ A TRAVÉS DE METATRANSCRIPTÓMICA
dc.type	Trabajo de grado - Pregrado
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coarversion	http://purl.org/coar/version/c_ab4af688f83e57aa
dc.type.content	Text
dc.type.driver	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.redcol	http://purl.org/redcol/resource_type/TP
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
dspace.entity.type	Publication