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Título : Composición de la comunidad desnitrificante tipo nosZ en la columna de agua del embalse de Prado-Tolima
Autor : Pacheco Montealegre, Mauricio Edilberto
Palabras clave : Desnitrificantes
Gen nosZ
Secuenciación 454
Reductasa de óxido nitroso
Ecología microbiana
Embalse
Denitrifiers
nosZ gene
454 sequencing
Oxide nitrous reductase
Microbial ecology
Reservoir
Fecha de publicación : Nov-2014
Editorial : Ibagué : Universidad del Tolima, 2014
Citación : Pacheco Montealegre, Mauricio Edilberto. Composición de la comunidad desnitrificante tipo nosZ en la columna de agua del embalse de Prado-Tolima. Ibagué : Universidad del Tolima, 2014.<http://repository.ut.edu.co/handle/001/1501>
Resumen : La desnitrificación es un proceso de reducción de nitrato a dinitrógeno, realizada por microorganismos anaeróbicos facultativos. Para ello, los microorganismos presentan genes funcionales que codifican las enzimas de la desnitrificación (reductasas). El gen nosZ codifica la enzima que reduce el óxido nitroso a dinitrógeno, y es implementado en investigaciones sobre los desnitrificantes. Este estudio analizó la composición (riqueza y abundancia) de la comunidad desnitrificante tipo-nosZ y su relación con factores ambientales (oxígeno, pH, temperatura, nitratos, nitritos y amonio) en tres áreas del embalse de Prado (Tolima): Isla del Sol, Lozanía y Tomogó, a profundidades donde la columna de agua presentó características subóxicas. Para esto se realizó el proceso de extracción de ADN, seguido por la amplificación y secuenciación 454 del gen nosZ. La riqueza y diversidad de genes-nosZ fueron medidas por el estimador CHAO1 y el índice Shannon; y la relación de las unidades taxonómicas operacionales (UTO) del gen nosZ con los factores ambientales se estableció mediante análisis de correspondencia canónica (ACC). En el embalse se encontraron 45 UTO’s, de las cuales el 89% fueron del tipo especialista debido a que son propias de cada área, y el 11% restante fueron considerados del tipo generalista. El área Lozanía presentó el mayor número de pirosecuencias válidas, así como la mayor diversidad (SCHAO1:35; H:2,0), en comparación a las otras áreas de estudio. El ACC mostró que la comunidad nosZ estuvo fuertemente relacionada con los bajos niveles de pH (6,2), oxígeno (0,01mg/L) y nitratos (<0,25mg/L) prevalentes en la columna de agua.
ABSTRACT. Denitrification is a process of reduction of nitrate to dinitrogen by facultative naerobes. For this, the microorganisms have functional genes encoding enzymes of the nitrification (reductases). The nosZ gene encoding the enzyme that reduces nitrous oxide to dinitrogen is implemented in research on denitrifying. This study analyzed the composition (richness and abundance) of type-nosZ denitrifying community and its relationship with environmental factors (oxygen, pH, temperature, nitrate, nitrite and ammonium) in three areas of the Prado reservoir (Tolima): Isla del Sol, Lozanía and Tomogó to suboxic depths. For this the DNA extraction, followed by amplification and 454 pyrosequencing of nosZ gene was performed. The richness and diversity of nosZ gen were measured by the estimator Chao1 and Shannon index; and the relationship between the composition of nosZ-operational taxonomic units (OTU) with environmental factors was established by canonical correspondence analysis (CCA). 45 OTU's were found in the reservoir, of which 89% were specialist type because they were specific to each area, and 11% were considered as generalist type. The Lozanía area had the highest number of pyrosequences and greater diversity (SCHAO1: 35; H: 2.0) compared to the other sampling stations. The ACC showed that the nosZ-community was strongly related to the low pH (6.2), oxygen (0.01mg / L) and nitrate (<0.25 mg / L) prevailing in the water column.
Descripción : 91 Páginas
Recurso Electrónico
URI : http://repository.ut.edu.co/handle/001/1501
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